在使用液相色谱柱之前，有一些注意事项需要注意。首先，要确保液相色谱柱的储存液与要分析的样品的流动相互溶。如果使用高浓度的盐或缓冲液作洗脱剂，应先用低浓度的有机相进行过渡，以避免盐在高浓度的有机相中析出并堵塞色谱柱。

流动相中所使用的有机溶剂应尽可能纯净，最好使用色谱纯级别的溶剂。水的选择最好是超纯水或全玻璃器皿的双蒸水，并且最好经过0.45μm的滤膜过滤一次，特别是含盐的流动相。此外，容器和色谱系统中的在线过滤器等装置应定期清洗或更换。

液相色谱柱的pH值适用范围通常为2.0-8.0。如果必须在边界条件下使用色谱柱，使用结束后应立即用适合于储存柱的溶剂清洗，并完全置换原来使用的流动相。

样品也应尽可能清洁，可以使用样品过滤器或样品预处理柱进行预处理。如果样品不便处理，应使用保护柱。在使用正相色谱法分析样品时，所有溶剂和样品应严格脱水。

每天实验后应对反相液相色谱柱进行保养。使用缓冲液或含盐的流动相后，应用甲醇/水（10%）冲洗色谱柱30分钟，以洗掉柱中的盐，然后用甲醇冲洗30分钟。注意，不能使用纯水冲洗柱子，应在水中加入10%的甲醇，以防止填料冲塌陷。

如果需要长期保存色谱柱，必须存放在适当的溶剂中。反相柱可以储存于纯甲醇或乙腈中，正相柱可以储存于严格脱水后的纯正己烷中，离子交换柱可以储存于含防腐剂叠氮化钠或柳硫汞的水中，并将购买时附送的堵头堵上。最好将柱存放在室温下。

色谱柱在使用过程中最常见的问题是柱压升高。如果柱压在长时间使用过程中缓慢增加，属于正常现象。但如果柱压在使用过程中突然升高（系统管路堵塞及压力传感器故障除外），可能的原因有以下几点：

1. 色谱柱头的过滤筛板堵塞或污染；

2. 色谱柱头的填料被样品污染；

3. 色谱柱内缓冲液中的盐遇到高浓度的甲醇或其他有机溶剂，形成结晶析出；

4. 流动相pH值过大或过小使固定相结构破坏或溶解。

1. 如果确定是色谱柱头的过滤筛板被污染，可以将色谱柱反方向用甲醇冲洗至正常压力，或者卸下色谱柱头，放在10%的稀硝酸内超声清洗10分钟，然后用纯水超声10分钟，重新装入色谱柱。

2. 如果确定色谱柱头的填料被污染，可以将柱头螺丝卸下，挖出柱内前段被污染的填料，用相同的柱填料重新填入，修复后重新安装柱头螺丝。

3. 如果确定是盐结晶，可以用10%的甲醇/水冲洗色谱柱使柱内盐全部溶解，然后换成高浓度甲醇。

4. 如果是由于pH值使用不当导致的问题，很难恢复。