实验组：加入anti-A的抗体…………最后用Western检验B蛋白。对照组（阴性对照）：加入IgG…………最后用Western检验B蛋白。

如果你的实验没有问题，那么出来的结果应该是：实验组：能看到较亮的B的Western条带。说明B能与A结合。(B与A结合，用Anti-A沉淀A蛋白，也就把B蛋白也一起沉淀下来了，因此Western能检测到。）阴性对照组：看不到B蛋白的Western条带 或者 条带较弱。 （因为IgG并不能特异性的与任何蛋白结合，那么IgG所带下来的蛋白都是非特异性的与IgG结合的蛋白，得到的东西就是背景。）简言之：anti-A的抗体由特异性的识别A蛋白的Fab片段和IgG片段组成。但是anti-A抗体有可能有非特异性结合，这些就是背景。而IgG的阴性对照的引入就是为了消除这个背景。如果实验结果正确，那么“实验组”的条带应该比“阴性对照组”亮很多。