重组无机焦磷酸酶是一种具有催化作用的酶,能够将一分子焦磷酸盐转化为两分子磷酸盐离子。这种反应具有高放能性,因此可以驱动一些热力学上不利的转化进行到完全。该酶在脂代谢、钙吸收、骨形成和DNA合成等生物过程中扮演着重要角色。
(1) 具有专一性的水解焦磷酸根的能力。
(2) 活性强、稳定性高且成本低。
在镁离子存在的情况下,重组无机焦磷酸酶能够将无机焦磷酸水解为2分子磷酸根。它可以在RNA体外合成或DNA聚合过程中水解生成的副产物焦磷酸,从而解除焦磷酸对反应的抑制,显著增加RNA或DNA的合成量。
(1) 用于RNA的体外合成。
(2) 防止DNA聚合过程中焦磷酸的累积。
(3) 在SNP分型实验中防止焦磷酸的污染。
在生物体内,核酸的合成会产生焦磷酸盐,而焦磷酸酶可以分解焦磷酸盐,避免其累积对生物体产生负面效应。然而,在PCR反应中,焦磷酸的累积同样会降低扩增效率并影响荧光染料的稳定性。
为了解决这个问题,人们添加无机焦磷酸酶到PCR反应中,将焦磷酸水解为正磷酸,从而增加反应混合液的pH值并提高荧光染料的稳定性。然而,由于PCR反应的高温要求,这种焦磷酸酶必须能耐受95℃的高温。
为了满足这一要求,研究人员重组表达了嗜热栖热菌HB27株的PPase基因,该酶具有较高的热稳定性。基于这个基因,构建了一种改造的热稳定无机焦磷酸酶,可以应用于需要更多循环数和反应时间的超敏PCR扩增,从而提高扩增效率。这种热稳定无机焦磷酸酶具有增强DNA复制的特点,并且在100℃加热4小时后仍具有100%的活性。
制备热稳定无机焦磷酸酶的方法是将原酶的氨基酸序列进行改造,改造后的酶具有更高的热稳定性。具体的改造方法包括改变氨基酸T为S、E为K、L为I或V为I、D为A、A为Q或K等。通过人工合成对应的碱基序列,扩增构建表达载体,并进行蛋白纯化。
[1] CN201710017276.4 一种改造的热稳定无机焦磷酸酶
无机焦磷酸酶(PPA)基因是植物糖代谢过程中的蔗糖合成调控基因,为将该基因运用于甘蔗转基因的研究,从面包酵母克隆了该基因。无机焦磷酸酶(酵母)纯化自重组 E. coli 菌株,携带有从酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)克隆的 ppa 基因和蟾分枝杆菌(Mycobacterium xenopi)GyrA 内含肽的融合基因。该焦磷酸酶催化无机焦磷酸盐水解生成正磷酸盐:P207-4 + H20 →2HP04-2。在核酸扩增实验中,其可解除生成的无机焦磷酸盐对反应体系的抑制。由 Biohelix 公司(现在是 Quidel 公司的全资子公司)研发。无机焦磷酸酶(英语:Inorganic Pyrophosphatase,简称为焦磷酸酶)是一种催化一分子焦磷酸盐转化为两分子磷酸盐离子的酶。这是一个高放能的反应,因此此反应可偶联到一些热力学上不利的转化,以便驱动这些转化进行到完全。此酶的功能乃是在脂代谢(包括脂合成与分解)、钙吸收以及骨形成和DNA合成中扮演重要角色,其他生物化学转化也是如此。
组分名称
数量
Yeast Pyrophosphatase (0.1 U/μl)
100 μl/1 ml
无机焦磷酸酶可用于反转录反应中提高 RNA 产量,以及增强 DNA 复制。
活性定义为在标准反应条件下(20mM Tris-HCl,pH 7.5,2mM MgCl2,2mM PPi,25℃ 反应 10 分钟),每分钟催化无机焦磷酸盐生成1μmol 磷酸盐所需的酶量。
该酶可在-20℃保存3年。
1. 该酶在多种反应Buffer中均具有活性,通常可直接接入HDA扩增、LAMP扩增等实验中。
2. 该酶的用量在不同的实验中需要优化,通常在0.05~1U/ml浓度调整。
3. 该酶的最佳反应温度为25℃,其在16~37℃均有活性,但65℃ 10min可使该酶失活。
[1] 范海阔, 黄东杰, 刘巧泉, 等. 无机焦磷酸化酶融合基因克隆分析及表达载体的构建[J]. 西南農業學報, 2007, 20(6): 1267-1271.