微生态（又称微生物组，microbiome），指特定环境（如人体）中，存在的所有微生物以及其所携带的遗传物质和功能的总和；它不仅包括环境中微生物间的相互作用，及微生物和环境间的相互关联，还包括微生物与环境中其他物种的相互关系。
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