如何进行ROI的圈选呢？

DSP支持5种圈选策略:

① 几何圈选：评估不同组织区域的组织异质性，按照特定的几何形状圈选目标区域，正方形，圆形，几何图形都可以

② 细胞亚型分选：从复杂组织中实现对细胞亚群或特定组织区域精细识别和精准分析

③ 等高线圈选：使用从中心区域辐射的等高线形状评估邻近区域如何影响生物过程和表达变化趋势

④ 网格分析：使用可调的网格模式进行全面、深度的空间定位分析

⑤ 稀有细胞圈选：在细胞类型特异的形态学标记指导下圈选组织中离散的特定细胞，揭示不同细胞亚群的信号通路和功能

其中几何圈选和细胞亚型分选是最常用到的两种圈选策略，具体如何圈选主要取决于研究者的研究目的，需要具体问题具体分析。需要注意的是，对于DSP转录组项目而言，每个ROI/AOI中至少包含100-200个细胞，对于DSP蛋白组项目而言，每个ROI/AOI中至少包含50个细胞，细胞数过少会导定量不准确或者建库失败

DSP区域圈选方式