百泰派克生物科技--盖德问答-化工人互助问答社区

百泰派克生物科技

影响力5.00

经验值0.00

粉丝0

以质谱技术为基础的蛋白质组学、代谢组学技服务专家。

关注已关注 私信

他的提问 0 他的回答 10

来自话题：

生物医学工程

，

磷酸化差异蛋白有哪些，目前是否有比较好的数据库可以查询? 您好，您想知道疾病组织和正常组织相比的差异蛋白，首先要进行定量蛋白组分析。进行定量蛋白组分析主要有DDA和SWATH/DIA两种方法，DDA技术是指数据依赖型质谱技术，主要包括SILAC、iTRAQ/TMT和Label Free技术，SILAC技术是一种体内标记技术，适合于可以传代培养的细胞样品，在细胞培养过程中，重标同位素的两种氨基酸通过细胞传代培养的方式逐渐掺入到整个蛋白质组中，从而将混合在一起处理不同组别的样品通过质谱进行区分。iTRAQ/TMT技术是一种体外标记技术，适用于不能进行传代培养的细胞样品、需要进行预处理的细胞样品以及组织样品。准备样品的过程中可以按照常规的方法进行蛋白的提取，在进行质谱分析之前，带有不同标签的iTRAQ/TMT试剂分别与不同的样品进行反应使得不同组别的样品带有不同分子质量标签，从而将混在一起处理的不同组别的样品通过质谱区分开来。Label Free也是现在常规的定量技术，不同组别样品不使用任何标签进行标记，每个样品单独进行质谱分析，通过比较质谱分析次数或质谱峰强度，分析不同来源样品蛋白的数量变化。SILAC和iTRAQ/TMT技术的蛋白通量要高于Label Free，相对应的价格也要比Label Free高一点；Label Free技术与SILAC和iTRAQ/TMT技术相比，其通量要低一些，性价比要高一些。通常来说，如果样品数量较少，可以使用传统的DDA定量方法，因为样品数量较少，可以在一次实验中同时处理，得到的结果准确，性价比较高，而对于大批量样品或者多批次实验的重现性会有一些影响。SWATH/DIA技术是一项区别于DDA采集的全新的、全息式的质谱技术，它将扫描区间内所有的肽段母离子经过超高速扫描并进行二级碎裂，使用二级碎片离子进行蛋白相对/绝对定量，从而获得完整的肽段信息，大大提高了定量的可重现性，因此当样品数量较多时，使用SWATH/DIA可以得到高重现性和准确度的结果。请问您样品数量具体有多少呢？如果样品数量不超过10个，针对您的样品类型是不能使用SILAC技术的，建议使用iTRAQ/TMT或者Label Free技术，具体使用哪种方法还是要看您具体实验目的和预算。如果您的实验是临床实验，样品数量较多，需要考虑使用DIA技术。其次，在进行磷酸化定量蛋白组分析之前，一般使用Thermo Scientific厂家生产的High-Select Fe-NTA Phosphopeptide Enrichment Kit 试剂盒对修饰进行富集，并且在富集肽段过程中要对单磷酸化肽段和多磷酸化肽段进行分步分离，从而分别进行质谱分析，避免多磷酸肽段在质谱分析过程中因为离子化效率的问题对单磷酸化肽段的鉴定和定量产生影响。磷酸化定量蛋白组的结果展示了不同组别之间有哪些发生了修饰，发生修饰的肽段信息，以及具体是哪个蛋白的哪个位点发生修饰。常用数据库有UniProt和NCBI，您可以根据您样品的物种类型找到相对应的序列即可。如果您想要做关于这方面的实验和分析，请联系我们，电话：15201377680（微信同号）。查看更多

0条评论

来自话题：

生物医学工程

，

如何设计蛋白组学策略? 1.您好，您设计的实验总体思路是可行的，具体细节方面您可以根据实验的结果添加一些特定的检测或者是验证。2.目前使用2DE技术的比较少，由于2DE技术存在一定的局限性，建议您使用DDA或者SWATH/DIA方法。DDA技术是指数据依赖型质谱技术，主要包括SILAC、iTRAQ/TMT和Label Free技术，SILAC技术是一种体内标记技术，适合于可以传代培养的细胞样品，在细胞培养过程中，重标同位素的两种氨基酸通过细胞传代培养的方式逐渐掺入到整个蛋白质组中，从而将混合在一起处理不同组别的样品通过质谱进行区分。iTRAQ/TMT技术是一种体外标记技术，适用于不能进行传代培养的细胞样品、需要进行预处理的细胞样品以及组织样品。准备样品的过程中可以按照常规的方法进行蛋白的提取，在进行质谱分析之前，带有不同标签的iTRAQ/TMT试剂分别与不同的样品进行反应使得不同组别的样品带有不同分子质量标签，从而将混在一起处理的不同组别的样品通过质谱区分开来。Label Free也是现在常规的定量技术，不同组别样品不使用任何标签进行标记，每个样品单独进行质谱分析，通过比较质谱分析次数或质谱峰强度，分析不同来源样品蛋白的数量变化。SILAC和iTRAQ/TMT技术的蛋白通量要高于Label Free，相对应的价格也要比Label Free高一点；Label Free技术与SILAC和iTRAQ/TMT技术相比，其通量要低一些，性价比要高一些。通常来说，如果样品数量少于10个，可以使用传统的DDA定量方法，因为样品数量较少，可以在一次实验中同时处理，得到的结果准确，性价比较高，而对于大批量样品或者多批次实验的重现性会有一些影响。SWATH/DIA技术是一项区别于DDA采集的全新的、全息式的质谱技术，它将扫描区间内所有的肽段母离子经过超高速扫描并进行二级碎裂，使用二级碎片离子进行蛋白相对/绝对定量，从而获得完整的肽段信息，大大提高了定量的可重现性。当样品数量较多时，使用SWATH/DIA可以得到高重现性和准确度的结果。具体使用哪种方法还要根据您的样品数量以及您的预算进行综合考虑。3.百泰派克生物科技有限公司以先进的色谱和质谱平台为基础，从事蛋白质和小分子代谢物的理化性质分析及结构解析相关技术服务，致力于为客户提供从试验设计、方法选择、数据筛选到生物信息学分析的一站式服务。欢迎咨询。查看更多

0条评论

质谱分析蛋白质？ 百泰派克生物科技有限公司，提供基于质谱的一站式蛋白质质谱分析服务，欢迎咨询.查看更多

0条评论

来自话题：

生物医学工程

，

蛋白质组学？ 如果是找代测服务，百泰派克生物科技提供基于质谱的蛋白质组学代测服务，欢迎咨询.查看更多

0条评论

来自话题：

生物医学工程

，

电泳有两条带，可以测序其中一条吗? 直接把想测的那一条切下来测序就可以。最好的分的比较开的，遮掩够可以避免杂质的干扰。查看更多

0条评论

来自话题：

生物医学工程

，

蛋白N端测序的，用岛津的PPSQ-31B测序，样品前处理？现在我知道可以电泳后转印，具体是怎么? 百泰派克小编来分享啦，你可以看下这个文档，讲转膜的：https://wenku.baidu.com/view/02320c42f524ccbff021840b.html查看更多

0条评论

来自话题：

生物医学工程

，

itraq蛋白质组价格？ 最近的价格一般在4000左右，看你的样品数，一般样品量多可以有折扣。欢迎来百泰派克咨询查看更多

0条评论

来自话题：

生物医学工程

，

工艺技术

，

如何做蛋白质的测序和合成? 如果要测序的话，肯定要先把每种蛋白纯化出来，这样纯度才能达到测序的标准。纯化之后，可以使用质谱测序的方法来做。查看更多

0条评论

来自话题：

生物医学工程

，

如何检测蛋白质磷酸化? 可以用质谱检测，磷酸化和非磷酸化的蛋白分子量是有差异的，质谱可以检测出来这种差异，就能确定是不是有磷酸化了。还能确定具体是哪个位点有磷酸化。查看更多

#蛋白质磷酸

0条评论

来自话题：

化学学科

，

请问蛋白质会堵塞液相色谱柱吗? 不知道你用的是什么柱子，测蛋白一般用C4的色谱柱，测完及时用乙腈冲洗，一般不会出现堵柱子的情况。要除去蛋白一般在溶液中加入甲醇，超声30min左右会使蛋白变性，产生沉淀，随后再用0.22um的微孔滤膜过滤。不过测糖和酒精用微孔滤膜过滤就可以了，百泰派克测度发酵液里面的糖，是用微孔滤膜过滤后直接检测的。查看更多

0条评论

简介

职业： -

学校： -

地区：北京市

个人简介：百泰派克生物科技主要从事蛋白质理化性质分析及结构解析、以质谱技术为基础的蛋白质组学、代谢组学技术服务。公司致力于建立国际领先的蛋白质研究分析技术平台，为各科研院所和大学提供高效、准确、性价比最优的蛋白质（组）研究技术包裹，协助客户在基础研究、分子诊断及其他生命科学研究领域取得突破，为生命科学的发展做出贡献。查看更多

企业简介

企业名称：北京百泰派克生物科技有限公司

企业性质：商业服务,生产商,

主营业务：蛋白质谱测序鉴定｜蛋白组学分析｜代谢组学分析｜脂质组学分析｜生物信息学分析

进入商铺

喜爱的版块返回首页

已连续签到天，累积获取个能量值

第1天
第2天
第3天
第4天
第5天
第6天
第7天