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干细胞因子的功能和机制? 1

干细胞因子(Stem Cell Factor,SCF)是一种重要的生物活性蛋白,也被称为肥大细胞生长因子或c-kit配体。它主要由骨髓基质细胞产生,能够调节造血干细胞、肥大细胞、黑色素细胞和生殖细胞的增殖、生长、分化和迁移等生理功能。此外,干细胞因子还在贫血治疗、骨髓移植、基因治疗、体外造血干细胞培养以及细胞移植和抗辐射损伤等领域得到广泛应用。

人和小鼠的干细胞因子在种属特异性方面存在差异,但它们的作用机制相似。由于干细胞因子的生物学活性不依赖于糖基化,因此利用原核表达系统可以有效地大量生产干细胞因子。

干细胞因子的功能与机制

干细胞因子对早期造血干细胞和祖细胞的增殖和定居起着关键作用,能够促进造血干细胞进入分裂周期。此外,干细胞因子还具有阻断或抑制红白血病细胞系的作用,可能与相关基因的异常表达和凋亡调控障碍有关。干细胞因子与其他生长因子如GM-CSF、C-CSF、IL-11和EPO等具有良好的协同作用,特别是与EPO联合应用效果更为明显。这种协同作用可能是因为干细胞因子直接刺激早期祖细胞或使其成为对EPO敏感的细胞。因此,联合应用干细胞因子和其他生长因子可以更好地扩增骨髓外周血细胞并获得足够的干细胞,对于骨髓移植的成功具有重要意义。

干细胞因子还对生殖细胞的增殖、成熟、存活和滤泡发育等起着重要的调节作用。它在睾丸和卵巢中均有表达,并与相应的受体发生结合。缺乏干细胞因子的小鼠会导致精子生成的缺失和严重贫血,甚至有些胎儿在胚胎期就会死亡。干细胞因子能够促进原始卵泡和初级卵泡的形成,并调节颗粒细胞和卵泡壁细胞之间的相互作用,影响卵母细胞的发育。此外,干细胞因子在单排卵物种和多排卵物种中的作用也有所不同。

参考文献

[1] 小鼠干细胞因子的大肠杆菌表达、纯化及活性测定 显示全部

干细胞因子(Stem Cell Factor,SCF)是一种重要的生物活性蛋白,也被称为肥大细胞生长因子或c-kit配体。它主要由骨髓基质细胞产生,能够调节造血干细胞、肥大细胞、黑色素细胞和生殖细胞的增殖、生长、分化和迁移等生理功能。此外,干细胞因子还在贫血治疗、骨髓移植、基因治疗、体外造血干细胞培养以及细胞移植和抗辐射损伤等领域得到广泛应用。

人和小鼠的干细胞因子在种属特异性方面存在差异,但它们的作用机制相似。由于干细胞因子的生物学活性不依赖于糖基化,因此利用原核表达系统可以有效地大量生产干细胞因子。

干细胞因子的功能与机制

干细胞因子对早期造血干细胞和祖细胞的增殖和定居起着关键作用,能够促进造血干细胞进入分裂周期。此外,干细胞因子还具有阻断或抑制红白血病细胞系的作用,可能与相关基因的异常表达和凋亡调控障碍有关。干细胞因子与其他生长因子如GM-CSF、C-CSF、IL-11和EPO等具有良好的协同作用,特别是与EPO联合应用效果更为明显。这种协同作用可能是因为干细胞因子直接刺激早期祖细胞或使其成为对EPO敏感的细胞。因此,联合应用干细胞因子和其他生长因子可以更好地扩增骨髓外周血细胞并获得足够的干细胞,对于骨髓移植的成功具有重要意义。

干细胞因子还对生殖细胞的增殖、成熟、存活和滤泡发育等起着重要的调节作用。它在睾丸和卵巢中均有表达,并与相应的受体发生结合。缺乏干细胞因子的小鼠会导致精子生成的缺失和严重贫血,甚至有些胎儿在胚胎期就会死亡。干细胞因子能够促进原始卵泡和初级卵泡的形成,并调节颗粒细胞和卵泡壁细胞之间的相互作用,影响卵母细胞的发育。此外,干细胞因子在单排卵物种和多排卵物种中的作用也有所不同。

参考文献

[1] 小鼠干细胞因子的大肠杆菌表达、纯化及活性测定

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细胞活性检测试剂盒的应用领域是什么? 1

概述[1]

细胞活性检测试剂盒(绿色/红色双重荧光)采用了两种非荧光性指示剂,分别是Calcein AM和一种非细胞渗透性的DNA结合染料。Calcein AM是一种疏水性复合物,可以轻易地渗透进入完整的活细胞,并通过酯酶的水解作用产生强烈的荧光。而DNA结合染料只有在与死细胞的DNA结合时才会发出荧光。通过测量酯酶的活性和DNA结合染料的荧光,可以定量分析细胞的活性和死亡情况。

该检测方法的应用领域是什么?[1]

细胞活性检测试剂盒(绿色/红色双重荧光)可以广泛应用于许多荧光实验平台的高通量分析中,例如微孔板分析、免疫组化和流式细胞术。该试剂盒提供了所有必需的组分和最佳的检测方案,适用于增殖型和非增殖型细胞,也可用于悬浮和贴壁细胞。每个试剂盒提供的试剂足够进行多次检测,可以满足实验的需求。

组份

Component A: CytoCalcein Green; Component B: Propidium Iodide; Component C: DMSO; Component D: Assay Buffer; Protocol

参考文献

[1]细胞活性检测试剂盒,绿红色双荧光产品介绍

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概述[1]

细胞活性检测试剂盒(绿色/红色双重荧光)采用了两种非荧光性指示剂,分别是Calcein AM和一种非细胞渗透性的DNA结合染料。Calcein AM是一种疏水性复合物,可以轻易地渗透进入完整的活细胞,并通过酯酶的水解作用产生强烈的荧光。而DNA结合染料只有在与死细胞的DNA结合时才会发出荧光。通过测量酯酶的活性和DNA结合染料的荧光,可以定量分析细胞的活性和死亡情况。

该检测方法的应用领域是什么?[1]

细胞活性检测试剂盒(绿色/红色双重荧光)可以广泛应用于许多荧光实验平台的高通量分析中,例如微孔板分析、免疫组化和流式细胞术。该试剂盒提供了所有必需的组分和最佳的检测方案,适用于增殖型和非增殖型细胞,也可用于悬浮和贴壁细胞。每个试剂盒提供的试剂足够进行多次检测,可以满足实验的需求。

组份

Component A: CytoCalcein Green; Component B: Propidium Iodide; Component C: DMSO; Component D: Assay Buffer; Protocol

参考文献

[1]细胞活性检测试剂盒,绿红色双荧光产品介绍

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如何高效提取小鼠腹腔巨噬细胞? 1

为了获得小鼠腹腔巨噬细胞,目前有两种提取方法。一种是直接腹腔灌洗后贴壁培养,另一种是通过注射刺激物制造无菌炎症环境以积聚巨噬细胞,然后再灌洗腹腔获取细胞并贴壁培养。然而,直接灌洗腹腔所得的细胞数量甚少,并不是理想的提取方法。而以炎症刺激巨噬细胞聚集再灌洗所得的细胞一直以来被认为是炎性甚至变异的,对于这两种方法提取的小鼠腹腔巨噬细胞之间的生物学差异还需要进一步研究。

采用何种方法可以高效提取小鼠腹腔巨噬细胞?

为了回答这个问题,进行了以下实验:

选取32只健康昆明小鼠,随机分为4组,每组8只。分别采用以下4种不同方法获得腹腔巨噬细胞:1. PBS直接灌洗小鼠腹腔(PBS组);2. 含10%血清的RPMI1640培养液注入小鼠腹腔,30min后灌洗小鼠腹腔(培养液组);3. 6%淀粉肉汤注入小鼠腹腔,每天1次,3天后以PBS灌洗腹腔(淀粉肉汤组);4. 3%巯基乙酸盐肉汤注入小鼠腹腔,每天1次,3天后以PBS灌洗腹腔(巯基乙酸盐组)。将各组所获细胞分别转入含10%血清的RPMI1640培养基中贴壁培养,并比较细胞形态、数量、吞噬能力、纯度以及活性。

牛磺酸对小鼠腹腔巨噬细胞有何调节作用?

实验方法:

收集小鼠腹腔巨噬细胞,调整细胞浓度为2×105/mL,分为5组,即正常对照组、LPS对照组(LPS终浓度为1μg/mL)和低、中、高牛磺酸剂量组(牛磺酸的终浓度分别为5、50和500μg/mL)。培养24小时后,使用ELISA法检测细胞上清中IL-12、TNF-α、IL-1、IL-6的含量;使用瑞氏染色法检测并计算巨噬细胞对白色葡萄球菌的吞噬率和吞噬指数,使用Griess法检测吞噬葡萄球菌后细胞上清中NO的含量。

结果显示,各剂量牛磺酸组的腹腔巨噬细胞TNF-α和IL-6含量均高于正常对照组(P < 0.05),高剂量牛磺酸组IL-12的含量高于对照组(P < 0.05),各剂量的牛磺酸组IL-1含量与对照组比较没有统计学意义;中、高剂量的牛磺酸组巨噬细胞对葡萄球菌的吞噬率、吞噬指数和上清中NO的含量均高于正常对照组(P < 0.05)。

参考文献

[1] 耿田欣,臧光耀,严金川.3%巯基乙酸盐肉汤诱导法高效提取小鼠腹腔巨噬细胞[J].江苏大学学报(医学版),2019,29(1):45-48

[2] 牛磺酸对小鼠腹腔巨噬细胞功能调节作用的体外研究.王亚敏

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为了获得小鼠腹腔巨噬细胞,目前有两种提取方法。一种是直接腹腔灌洗后贴壁培养,另一种是通过注射刺激物制造无菌炎症环境以积聚巨噬细胞,然后再灌洗腹腔获取细胞并贴壁培养。然而,直接灌洗腹腔所得的细胞数量甚少,并不是理想的提取方法。而以炎症刺激巨噬细胞聚集再灌洗所得的细胞一直以来被认为是炎性甚至变异的,对于这两种方法提取的小鼠腹腔巨噬细胞之间的生物学差异还需要进一步研究。

采用何种方法可以高效提取小鼠腹腔巨噬细胞?

为了回答这个问题,进行了以下实验:

选取32只健康昆明小鼠,随机分为4组,每组8只。分别采用以下4种不同方法获得腹腔巨噬细胞:1. PBS直接灌洗小鼠腹腔(PBS组);2. 含10%血清的RPMI1640培养液注入小鼠腹腔,30min后灌洗小鼠腹腔(培养液组);3. 6%淀粉肉汤注入小鼠腹腔,每天1次,3天后以PBS灌洗腹腔(淀粉肉汤组);4. 3%巯基乙酸盐肉汤注入小鼠腹腔,每天1次,3天后以PBS灌洗腹腔(巯基乙酸盐组)。将各组所获细胞分别转入含10%血清的RPMI1640培养基中贴壁培养,并比较细胞形态、数量、吞噬能力、纯度以及活性。

牛磺酸对小鼠腹腔巨噬细胞有何调节作用?

实验方法:

收集小鼠腹腔巨噬细胞,调整细胞浓度为2×105/mL,分为5组,即正常对照组、LPS对照组(LPS终浓度为1μg/mL)和低、中、高牛磺酸剂量组(牛磺酸的终浓度分别为5、50和500μg/mL)。培养24小时后,使用ELISA法检测细胞上清中IL-12、TNF-α、IL-1、IL-6的含量;使用瑞氏染色法检测并计算巨噬细胞对白色葡萄球菌的吞噬率和吞噬指数,使用Griess法检测吞噬葡萄球菌后细胞上清中NO的含量。

结果显示,各剂量牛磺酸组的腹腔巨噬细胞TNF-α和IL-6含量均高于正常对照组(P < 0.05),高剂量牛磺酸组IL-12的含量高于对照组(P < 0.05),各剂量的牛磺酸组IL-1含量与对照组比较没有统计学意义;中、高剂量的牛磺酸组巨噬细胞对葡萄球菌的吞噬率、吞噬指数和上清中NO的含量均高于正常对照组(P < 0.05)。

参考文献

[1] 耿田欣,臧光耀,严金川.3%巯基乙酸盐肉汤诱导法高效提取小鼠腹腔巨噬细胞[J].江苏大学学报(医学版),2019,29(1):45-48

[2] 牛磺酸对小鼠腹腔巨噬细胞功能调节作用的体外研究.王亚敏

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如何检测尿嘧啶DNA糖基化酶的活性? 1

尿嘧啶DNA糖基化酶 (UDG) 是一种关键的DNA修复酶,有助于保持基因组的完整性。UDG特异性移除DNA中的尿嘧啶 (U) 碱基,产生无嘌呤/无嘧啶 (AP) 位点用于下游的修复过程。UDG活性的异常能导致修复过程紊乱和基因突变,最终导致相关疾病,包括淋巴瘤、布卢姆综合症和人类免疫缺陷病。因此,检测UDG活性是一种候选工具用于生物医学研究和疾病预后。

如何检测UDG活性的常用策略?

检测UDG活性的常用策略包括凝胶策略、电化学策略和比色策略。与这些策略相比,荧光策略由于具有安全、简单和灵敏的优点而受到关注。检测UDG活性的荧光策略一般是基于含多个U碱基的DNA探针。

当UDG移除DNA探针中的多个U碱基时,DNA探针的构型将会发生变化,进而将对目标物UDG的识别事件转换成输出信号。尽管这些策略已经实现了良好的性能,但是仍然存在一些不足影响它们在检测低活性UDG中的应用。由于每个DNA探针中的多个U碱基不能被低活性的UDG同时移除,使得DNA探针的构型不能发生彻底的改变,从而导致低效率的信号转导。因此,期望发展一种信号转导效率高的新型荧光策略用于UDG活性的检测。

连接酶反应是指在连接DNA双链中的单链缺口时,DNA连接酶只能在缺口两侧碱基对完全匹配时,才能将其特异性地连接。而当缺口3’侧存在碱基错配时,连接酶反应将被抑制。这里,发展了一种连接酶反应介导的荧光策略用于高效检测UDG活性。

首先,两条短寡核苷酸链分别与发夹探针环部序列的一半进行杂交,形成含缺口的DNA复合物。此时,这两条短寡核苷酸链的刚性不足以打开发夹探针。

然后,在UDG的作用下,发夹探针环部的单个U碱基被移除并产生AP位点。其中,AP位点也是一种类型的碱基错配。相应地,位于缺口3’侧的AP位点能抑制连接酶反应,使得位于发夹探针末端的立足点和链迁移区域仍保持彼此邻近的状态。随后,邻近的立足点和链迁移区域能够引发杂交链式反应 (HCR) 反应,产生大量的G四倍体 (G4) 结构。

最后,G4结构能与N甲基卟啉IX (NMM) 相互作用,产生增强的荧光信号。当UDG不存在时,连接酶反应能将缺口两侧短寡核苷酸链连接成一条刚性增强的长DNA链,进而将发夹探针打开,使得位于发夹探针末端的立足点和链迁移区域彼此分离,不能引发随后的HCR反应。本策略对UDG活性的检测限低至0.00020U/mL,并能将UDG与其它DNA糖基化酶很好地区分开来。此外,本策略也能用于检测HeLa细胞裂解液中的UDG活性,并且细胞中其它组分对本策略造成的干扰很小。

如何切除DNA序列中不应存在的尿嘧啶?

此检测方法的原理是利用UDG酶切除双链DNA ON1-ON2中具有尿嘧啶的ON2,释放出富含G碱基的ON1。随后,ON1折叠形成G-四链体,与卢宇靖课题组合成的高选择性荧光探针DID-VP结合,产生荧光。即通过荧光强度与UDG浓度形成,达到对UDG线性检测的目的。

参考文献

[1] 连接酶反应介导的荧光策略用于高效检测尿嘧啶-DNA糖基化酶的活性.吴玉姝 吴敏 刘敏.聊城大学生物制药研究院 聊城市人民医院

[2] Souza-Pinto N C, Harris C C, Bohr V A.p53functions in the incorporation step in DNA base excision repair in mouse liver mitochondria[J].Oncogene, 2004, 23:6559-6568.

[3] Wabuyele M B, Farquar H, Stryjewski W, et al.Approaching real-time molecular diagnostics:single-pair fluorescence resonance energy transfer (spFRET) detection for the analysis of low abundant point mutations in K-ras oncogenes[J].J Am Chem Soc, 2003, 125:6937-6945.

[4] Sensitive and selective detection of uracil-DNA glycosylase activity with a new pyridinium luminescent switch-on molecular probe. 显示全部

尿嘧啶DNA糖基化酶 (UDG) 是一种关键的DNA修复酶,有助于保持基因组的完整性。UDG特异性移除DNA中的尿嘧啶 (U) 碱基,产生无嘌呤/无嘧啶 (AP) 位点用于下游的修复过程。UDG活性的异常能导致修复过程紊乱和基因突变,最终导致相关疾病,包括淋巴瘤、布卢姆综合症和人类免疫缺陷病。因此,检测UDG活性是一种候选工具用于生物医学研究和疾病预后。

如何检测UDG活性的常用策略?

检测UDG活性的常用策略包括凝胶策略、电化学策略和比色策略。与这些策略相比,荧光策略由于具有安全、简单和灵敏的优点而受到关注。检测UDG活性的荧光策略一般是基于含多个U碱基的DNA探针。

当UDG移除DNA探针中的多个U碱基时,DNA探针的构型将会发生变化,进而将对目标物UDG的识别事件转换成输出信号。尽管这些策略已经实现了良好的性能,但是仍然存在一些不足影响它们在检测低活性UDG中的应用。由于每个DNA探针中的多个U碱基不能被低活性的UDG同时移除,使得DNA探针的构型不能发生彻底的改变,从而导致低效率的信号转导。因此,期望发展一种信号转导效率高的新型荧光策略用于UDG活性的检测。

连接酶反应是指在连接DNA双链中的单链缺口时,DNA连接酶只能在缺口两侧碱基对完全匹配时,才能将其特异性地连接。而当缺口3’侧存在碱基错配时,连接酶反应将被抑制。这里,发展了一种连接酶反应介导的荧光策略用于高效检测UDG活性。

首先,两条短寡核苷酸链分别与发夹探针环部序列的一半进行杂交,形成含缺口的DNA复合物。此时,这两条短寡核苷酸链的刚性不足以打开发夹探针。

然后,在UDG的作用下,发夹探针环部的单个U碱基被移除并产生AP位点。其中,AP位点也是一种类型的碱基错配。相应地,位于缺口3’侧的AP位点能抑制连接酶反应,使得位于发夹探针末端的立足点和链迁移区域仍保持彼此邻近的状态。随后,邻近的立足点和链迁移区域能够引发杂交链式反应 (HCR) 反应,产生大量的G四倍体 (G4) 结构。

最后,G4结构能与N甲基卟啉IX (NMM) 相互作用,产生增强的荧光信号。当UDG不存在时,连接酶反应能将缺口两侧短寡核苷酸链连接成一条刚性增强的长DNA链,进而将发夹探针打开,使得位于发夹探针末端的立足点和链迁移区域彼此分离,不能引发随后的HCR反应。本策略对UDG活性的检测限低至0.00020U/mL,并能将UDG与其它DNA糖基化酶很好地区分开来。此外,本策略也能用于检测HeLa细胞裂解液中的UDG活性,并且细胞中其它组分对本策略造成的干扰很小。

如何切除DNA序列中不应存在的尿嘧啶?

此检测方法的原理是利用UDG酶切除双链DNA ON1-ON2中具有尿嘧啶的ON2,释放出富含G碱基的ON1。随后,ON1折叠形成G-四链体,与卢宇靖课题组合成的高选择性荧光探针DID-VP结合,产生荧光。即通过荧光强度与UDG浓度形成,达到对UDG线性检测的目的。

参考文献

[1] 连接酶反应介导的荧光策略用于高效检测尿嘧啶-DNA糖基化酶的活性.吴玉姝 吴敏 刘敏.聊城大学生物制药研究院 聊城市人民医院

[2] Souza-Pinto N C, Harris C C, Bohr V A.p53functions in the incorporation step in DNA base excision repair in mouse liver mitochondria[J].Oncogene, 2004, 23:6559-6568.

[3] Wabuyele M B, Farquar H, Stryjewski W, et al.Approaching real-time molecular diagnostics:single-pair fluorescence resonance energy transfer (spFRET) detection for the analysis of low abundant point mutations in K-ras oncogenes[J].J Am Chem Soc, 2003, 125:6937-6945.

[4] Sensitive and selective detection of uracil-DNA glycosylase activity with a new pyridinium luminescent switch-on molecular probe.

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转录组测序的应用及发展前景? 1

转录组测序是一种利用新一代高通量测序技术对组织或细胞中所有mRNA进行测序研究的方法。通过转录组测序及分析技术,可以深入挖掘新基因、发现低丰度转录本、绘制转录图谱、调控可变剪切、确定代谢途径、鉴定基因家族及进行进化分析等。该技术已经在生物学、医学、农学等领域得到广泛应用,并成为生物学发展最快的测序技术之一。

除了在个体材料中的应用,转录组测序也逐渐扩大到自然群体和遗传群体的材料中,包括发育调控、环境适应、免疫互作和表观调控等方面的研究。随着测序技术的不断发展,三代测序技术的出现以及转录组测序分析结果的不断完善,未来转录组测序在高等植物中的应用将更加广泛。

对于那些没有参考基因组的新物种,denovo转录组测序可以通过分析策略帮助研究人员快速获取该物种的mRNA序列,并预测可能的非编码RNA。此外,denovo转录组测序还可以获得cSNP,从而提供全面的转录组信息。以兜兰为例,通过denovo转录组测序服务,研究人员对同色兜兰、带叶兜兰以及两个栽培品种进行了测序,并发现了与单独开花行为有关的转录因子。同时,还找到了大量可用于分子标记的EST-SSR和引物SSR,为兜兰开花与花的发育的分子机制提供了一定的了解。

主要参考资料

[1]转录组测序在高等植物中的研究进展

[2]LiuS,RaoXJ,LiMY,etal.IdentificationofcandidatechemosensorygenesintheantennaltranscriptomeofTenebriomolitor(Coleoptera:Tenebrionidae).CompBiochemPhysiolPartDGenomicsProteomics.2015,13:44-51.

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转录组测序是一种利用新一代高通量测序技术对组织或细胞中所有mRNA进行测序研究的方法。通过转录组测序及分析技术,可以深入挖掘新基因、发现低丰度转录本、绘制转录图谱、调控可变剪切、确定代谢途径、鉴定基因家族及进行进化分析等。该技术已经在生物学、医学、农学等领域得到广泛应用,并成为生物学发展最快的测序技术之一。

除了在个体材料中的应用,转录组测序也逐渐扩大到自然群体和遗传群体的材料中,包括发育调控、环境适应、免疫互作和表观调控等方面的研究。随着测序技术的不断发展,三代测序技术的出现以及转录组测序分析结果的不断完善,未来转录组测序在高等植物中的应用将更加广泛。

对于那些没有参考基因组的新物种,denovo转录组测序可以通过分析策略帮助研究人员快速获取该物种的mRNA序列,并预测可能的非编码RNA。此外,denovo转录组测序还可以获得cSNP,从而提供全面的转录组信息。以兜兰为例,通过denovo转录组测序服务,研究人员对同色兜兰、带叶兜兰以及两个栽培品种进行了测序,并发现了与单独开花行为有关的转录因子。同时,还找到了大量可用于分子标记的EST-SSR和引物SSR,为兜兰开花与花的发育的分子机制提供了一定的了解。

主要参考资料

[1]转录组测序在高等植物中的研究进展

[2]LiuS,RaoXJ,LiMY,etal.IdentificationofcandidatechemosensorygenesintheantennaltranscriptomeofTenebriomolitor(Coleoptera:Tenebrionidae).CompBiochemPhysiolPartDGenomicsProteomics.2015,13:44-51.

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全基因组重测序的应用及测序指标? 1

背景及概述[1]

全基因组重测序是对已有参考基因组序列的物种进行个体或群体全基因组测序的方法。通过与参考基因组序列进行比对,可以检测出全基因组范围的各种变异信息,包括单核苷酸多态、插入缺失突变、拷贝数变异和机构变异等。全基因组重测序数据分析的关键在于序列比对,将重测序所得的reads序列与参考基因组序列进行比较和定位。

全基因组低覆盖度重测序[1]

全基因组低覆盖度重测序是全基因组重测序的一种方法。测序深度和测序覆盖度是评价测序量的两个重要指标。测序深度是指测序获取的碱基总量与基因组大小的比值,测序深度越大,假阳性结果的概率越小。测序覆盖度指基因组被测序得到的碱基覆盖的比例,反映测序的随机性。测序深度和覆盖度之间存在正相关关系。

全基因组重测序的应用[2]

全基因组低覆盖度重测序可以应用于各种实验研究。例如,通过全基因组低覆盖度重测序和目标区域捕获测序技术,可以探讨胎儿先天性心脏病基因型与临床表型之间的关联性,为先天性心脏病的发病机制研究提供信息。

主要参考资料

[1]全基因组重测序及其在动物育种的研究进展

[2]胎儿先天性心脏病的全基因组低覆盖度测序及目标区域捕获测序研究

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背景及概述[1]

全基因组重测序是对已有参考基因组序列的物种进行个体或群体全基因组测序的方法。通过与参考基因组序列进行比对,可以检测出全基因组范围的各种变异信息,包括单核苷酸多态、插入缺失突变、拷贝数变异和机构变异等。全基因组重测序数据分析的关键在于序列比对,将重测序所得的reads序列与参考基因组序列进行比较和定位。

全基因组低覆盖度重测序[1]

全基因组低覆盖度重测序是全基因组重测序的一种方法。测序深度和测序覆盖度是评价测序量的两个重要指标。测序深度是指测序获取的碱基总量与基因组大小的比值,测序深度越大,假阳性结果的概率越小。测序覆盖度指基因组被测序得到的碱基覆盖的比例,反映测序的随机性。测序深度和覆盖度之间存在正相关关系。

全基因组重测序的应用[2]

全基因组低覆盖度重测序可以应用于各种实验研究。例如,通过全基因组低覆盖度重测序和目标区域捕获测序技术,可以探讨胎儿先天性心脏病基因型与临床表型之间的关联性,为先天性心脏病的发病机制研究提供信息。

主要参考资料

[1]全基因组重测序及其在动物育种的研究进展

[2]胎儿先天性心脏病的全基因组低覆盖度测序及目标区域捕获测序研究

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链特异性转录组测序的优势及应用领域是什么? 1

链特异性转录组测序是一种在文库构建过程中保存RNA链方向信息的方法,通过测序和数据分析可以确定转录本来自正义链还是反义链。链特异性建库的方式是使用dUTP替换dTTP来合成cDNA的第二条链,然后用USER酶降解第二条链并进行PCR扩增,制备文库。这种方法在研究基因结构和基因表达调控等领域得到广泛应用。

链特异性转录组测序的优势主要包括:

1)获得更准确的基因表达定量:链特异性测序保留了RNA链的方向信息,降低了read ambiguity的比例,解决了由于反向转录本带来的reads数而使表达量虚高的问题,使基因表达定量更准确。

2)提高发掘circRNA的准确率:链特异性文库可以排除反义转录本的影响,更精确地检测可变剪切,降低可变剪切事件识别的假阳性,从而提高circRNA检测的准确率。

3)识别非编码反义转录本:链特异性测序可以检测非编码反义转录本,确定位于基因间的非编码转录本的方向,这是普通转录组测序无法实现的。

4)更好地预测新转录本:明确转录本的方向性对于预测新的转录本非常重要,如果不能区分正反链,编码与非编码转录本可能会被组装成一条转录本。

5)原核生物操纵子分析:链特异性测序能够更准确地对原核生物的操纵子进行分析与鉴定,因为原核生物的基因多是多顺反子的结构。

主要参考资料

[1]基于链特异性RNA测序技术的黄曲霉CA43的转录组学研究

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链特异性转录组测序是一种在文库构建过程中保存RNA链方向信息的方法,通过测序和数据分析可以确定转录本来自正义链还是反义链。链特异性建库的方式是使用dUTP替换dTTP来合成cDNA的第二条链,然后用USER酶降解第二条链并进行PCR扩增,制备文库。这种方法在研究基因结构和基因表达调控等领域得到广泛应用。

链特异性转录组测序的优势主要包括:

1)获得更准确的基因表达定量:链特异性测序保留了RNA链的方向信息,降低了read ambiguity的比例,解决了由于反向转录本带来的reads数而使表达量虚高的问题,使基因表达定量更准确。

2)提高发掘circRNA的准确率:链特异性文库可以排除反义转录本的影响,更精确地检测可变剪切,降低可变剪切事件识别的假阳性,从而提高circRNA检测的准确率。

3)识别非编码反义转录本:链特异性测序可以检测非编码反义转录本,确定位于基因间的非编码转录本的方向,这是普通转录组测序无法实现的。

4)更好地预测新转录本:明确转录本的方向性对于预测新的转录本非常重要,如果不能区分正反链,编码与非编码转录本可能会被组装成一条转录本。

5)原核生物操纵子分析:链特异性测序能够更准确地对原核生物的操纵子进行分析与鉴定,因为原核生物的基因多是多顺反子的结构。

主要参考资料

[1]基于链特异性RNA测序技术的黄曲霉CA43的转录组学研究

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宏基因组学在环境微生物研究中的应用是什么? 1

宏基因组学(也称元基因组学)是一种研究环境样品中微生物基因组集合的技术和方法。它可以通过分类和鉴定核糖体rDNA(细菌和古细菌16SrDNA或真菌18S、28SrDNA和ITS),分析功能基因(如固氮还原酶nifH基因和氨基氧化酶amoA基因等)的多样性和分类,以及对整体宏基因组DNA进行测序和分析等。目前,高通量检测技术,如基因芯片技术和高通量测序技术,是宏基因组研究的主要手段。这两种技术各有优势和缺陷。基因芯片技术可以筛选出已知物种或具有明确功能的基因信息,但无法检测未知物种或功能基因。相比之下,高通量测序技术可以获取特定基因的大多数操作分类单元(OTU)及其个体数量,或者宏基因组中的大片段DNA的信息,从而准确反映微生物群落的组成、结构和遗传进化关系等。宏基因组学已经成为环境微生物研究的主导技术,并且随着宏基因组shotgun方法测序通量的增加和成本的降低,其应用范围将进一步扩大。

宏基因组shotgun方法测序是一种针对特定环境样品中微生物群体基因组的测序方法,特别适用于那些种类众多且难以培养的微生物。通过对微生物群体基因组的序列测定和功能基因的发掘,可以分析微生物群体的基因组成和功能,解读微生物群体的多样性和丰度,并发现和研究具有特定功能的新基因。宏基因组shotgun方法测序包括MetaPhlAn(群落组成分析)、PICRUSt(基因组功能预测)、PhyloPhlAn(构建系统发育树)和GraPhlAn(可视化分类和系统发育信息)等。

主要参考资料

[1] 环境微生物宏基因组学研究中的生物信息学方法

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宏基因组学(也称元基因组学)是一种研究环境样品中微生物基因组集合的技术和方法。它可以通过分类和鉴定核糖体rDNA(细菌和古细菌16SrDNA或真菌18S、28SrDNA和ITS),分析功能基因(如固氮还原酶nifH基因和氨基氧化酶amoA基因等)的多样性和分类,以及对整体宏基因组DNA进行测序和分析等。目前,高通量检测技术,如基因芯片技术和高通量测序技术,是宏基因组研究的主要手段。这两种技术各有优势和缺陷。基因芯片技术可以筛选出已知物种或具有明确功能的基因信息,但无法检测未知物种或功能基因。相比之下,高通量测序技术可以获取特定基因的大多数操作分类单元(OTU)及其个体数量,或者宏基因组中的大片段DNA的信息,从而准确反映微生物群落的组成、结构和遗传进化关系等。宏基因组学已经成为环境微生物研究的主导技术,并且随着宏基因组shotgun方法测序通量的增加和成本的降低,其应用范围将进一步扩大。

宏基因组shotgun方法测序是一种针对特定环境样品中微生物群体基因组的测序方法,特别适用于那些种类众多且难以培养的微生物。通过对微生物群体基因组的序列测定和功能基因的发掘,可以分析微生物群体的基因组成和功能,解读微生物群体的多样性和丰度,并发现和研究具有特定功能的新基因。宏基因组shotgun方法测序包括MetaPhlAn(群落组成分析)、PICRUSt(基因组功能预测)、PhyloPhlAn(构建系统发育树)和GraPhlAn(可视化分类和系统发育信息)等。

主要参考资料

[1] 环境微生物宏基因组学研究中的生物信息学方法

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为什么高通量RNA测序技术成为研究基因表达和转录组的重要实验手段? 1

近年来,新一代高通量测序技术得到了突飞猛进的发展。在此基础上,高通量RNA测序即RNA-seq也迅速发展。与基因芯片技术相比,RNA-seq无需设计探针,能在全基因组范围内以单碱基分辨率检测和量化转录片段,并能应用于基因组图谱尚未完成的物种。RNA-seq具有信噪比高、分辨率高、应用范围广等优势,正成为研究基因表达和转录组的重要实验手段。RNA-seq为基因组学的研究带来了高分辨率的海量数据,如何有效处理和分析这些海量数据成为这一新技术能否带来新的科学发现的关键,一些生物信息学方法与软件也应运而生。小RNA测序(smallRNA测序)是RNA-seq的一种。

如何应用小RNA测序技术?

1)研究采用小RNA测序技术对2株显症和无症状的‘阳光玫瑰’葡萄样品进行病毒鉴定。结果显示:显症样品中测定到8种病毒,其中包含葡萄蚕豆萎蔫病毒(Grapevinefabavirus,GFabV)和灰比诺葡萄病毒(GrapevinePinotgrisvirus,GPGV);无症状样品中测定到3种葡萄病毒。对46个‘阳光玫瑰’样品进行14种葡萄病毒的RT-PCR检测,结果表明;‘阳光玫瑰’葡萄带毒率较高,病毒复合侵染情况普遍;显症样品中,GFabV检出率为88.2%,GPGV和葡萄浆果内坏死病毒(Grapevineberryinnernecrosisvirus,GINV)检出率为64.7%和29.4%,均明显高于无症状样品(13.8%和10.3%)。

2)通过smallRNA测序对高温耐受型棉花品系‘84021’和高温敏感型棉花品系‘H05’高温处理前后的不同发育时期的花药进行分析,发现了大量参与高温响应的smallRNA。部分研究结果利用smallRNA测序技术对正常温度和高温胁迫下高温耐受型棉花品系‘84021’和高温敏感型棉花品系‘H05’的2个不同发育时期(TS和TDS)的16个花药样品(包含2个生物学重复)进行smallRNA分析。从测序结果中共鉴定到112个已知的miRNA和270个新发现的miRNA,通过进一步筛选获得27个表达丰度较高且响应高温胁迫的miRNA。随后通过qRT-PCR对smallRNA测序的结果进行验证,并在‘84021’和‘H05’中对部分候选miRNA进行表达分析,通过测序及表达验证,筛选获得了一些参与高温响应以及花药发育的miRNA,如miR156/157,miR160,miR167,miR172等,为后续研究miRNA在花药发育及高温响应中的作用提供数据支持。

主要参考资料

[1] 新一代高通量RNA测序数据的处理与分析阳光玫瑰’葡萄病毒小RNA测序鉴定及RT-PCR检测

[2] 高温胁迫引起的棉花雄性不育中smallRNA高通量测序分析及microRNA功能验证

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近年来,新一代高通量测序技术得到了突飞猛进的发展。在此基础上,高通量RNA测序即RNA-seq也迅速发展。与基因芯片技术相比,RNA-seq无需设计探针,能在全基因组范围内以单碱基分辨率检测和量化转录片段,并能应用于基因组图谱尚未完成的物种。RNA-seq具有信噪比高、分辨率高、应用范围广等优势,正成为研究基因表达和转录组的重要实验手段。RNA-seq为基因组学的研究带来了高分辨率的海量数据,如何有效处理和分析这些海量数据成为这一新技术能否带来新的科学发现的关键,一些生物信息学方法与软件也应运而生。小RNA测序(smallRNA测序)是RNA-seq的一种。

如何应用小RNA测序技术?

1)研究采用小RNA测序技术对2株显症和无症状的‘阳光玫瑰’葡萄样品进行病毒鉴定。结果显示:显症样品中测定到8种病毒,其中包含葡萄蚕豆萎蔫病毒(Grapevinefabavirus,GFabV)和灰比诺葡萄病毒(GrapevinePinotgrisvirus,GPGV);无症状样品中测定到3种葡萄病毒。对46个‘阳光玫瑰’样品进行14种葡萄病毒的RT-PCR检测,结果表明;‘阳光玫瑰’葡萄带毒率较高,病毒复合侵染情况普遍;显症样品中,GFabV检出率为88.2%,GPGV和葡萄浆果内坏死病毒(Grapevineberryinnernecrosisvirus,GINV)检出率为64.7%和29.4%,均明显高于无症状样品(13.8%和10.3%)。

2)通过smallRNA测序对高温耐受型棉花品系‘84021’和高温敏感型棉花品系‘H05’高温处理前后的不同发育时期的花药进行分析,发现了大量参与高温响应的smallRNA。部分研究结果利用smallRNA测序技术对正常温度和高温胁迫下高温耐受型棉花品系‘84021’和高温敏感型棉花品系‘H05’的2个不同发育时期(TS和TDS)的16个花药样品(包含2个生物学重复)进行smallRNA分析。从测序结果中共鉴定到112个已知的miRNA和270个新发现的miRNA,通过进一步筛选获得27个表达丰度较高且响应高温胁迫的miRNA。随后通过qRT-PCR对smallRNA测序的结果进行验证,并在‘84021’和‘H05’中对部分候选miRNA进行表达分析,通过测序及表达验证,筛选获得了一些参与高温响应以及花药发育的miRNA,如miR156/157,miR160,miR167,miR172等,为后续研究miRNA在花药发育及高温响应中的作用提供数据支持。

主要参考资料

[1] 新一代高通量RNA测序数据的处理与分析阳光玫瑰’葡萄病毒小RNA测序鉴定及RT-PCR检测

[2] 高温胁迫引起的棉花雄性不育中smallRNA高通量测序分析及microRNA功能验证

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哪些物种的全基因组SNP芯片服务包括在Illumina的动植物全基因组SNP芯片服务中? 1

在Illumina的动植物全基因组SNP芯片服务中,包括了哪些物种的全基因组SNP芯片服务呢?这些物种包括牛、羊、马、猪和犬。

对于牛来说,Illumina与牛类研究专家联合开发了Bovine HD BeadChip,该芯片可以检测777,962个SNPs。

羊的芯片名称为Ovine SNP50 BeadChip,它由Illumina与国际羊基因组协会专家联合开发,包含了54,241个SNP位点,平均每46kb有一个标记,覆盖整个基因组。

马的芯片名称为Equine SNP50 BeadChip,它包含了54,602个SNP位点,这些位点均匀分布在15个品种马匹的全基因组序列上,SNP的平均间隔为43.2kb。

猪的芯片名称为Porcine SNP60 BeadChip,它包含了62,163个SNP位点,覆盖了猪的全基因组。此款芯片整合了多种猪的基因差异,包括杜洛克猪、长白猪,皮特兰猪和大白猪。

犬的芯片名称为Canine HD BeadChip,它包含超过170,000个SNP位点,可以对任何一种家养犬类进行全基因组扫描。

此外,Illumina的植物全基因组SNP芯片服务还包括了玉米、甘蓝、樱桃、桃子、大豆、辣椒、小麦、苹果、葡萄、燕麦、番茄、小麦、大麦、马铃薯、向日葵、棉花、水稻和豆类等物种。其中,玉米芯片名称为Maize SNP50 BeadChip,包含了56,110个玉米SNP位点;甘蓝芯片名称为Intl Brassica SNP Consortium,包含了52,157个甘蓝SNP位点。其他植物品种也都有自己的芯片名称。

主要参考资料

[1] Illumina芯片服务平台介绍

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在Illumina的动植物全基因组SNP芯片服务中,包括了哪些物种的全基因组SNP芯片服务呢?这些物种包括牛、羊、马、猪和犬。

对于牛来说,Illumina与牛类研究专家联合开发了Bovine HD BeadChip,该芯片可以检测777,962个SNPs。

羊的芯片名称为Ovine SNP50 BeadChip,它由Illumina与国际羊基因组协会专家联合开发,包含了54,241个SNP位点,平均每46kb有一个标记,覆盖整个基因组。

马的芯片名称为Equine SNP50 BeadChip,它包含了54,602个SNP位点,这些位点均匀分布在15个品种马匹的全基因组序列上,SNP的平均间隔为43.2kb。

猪的芯片名称为Porcine SNP60 BeadChip,它包含了62,163个SNP位点,覆盖了猪的全基因组。此款芯片整合了多种猪的基因差异,包括杜洛克猪、长白猪,皮特兰猪和大白猪。

犬的芯片名称为Canine HD BeadChip,它包含超过170,000个SNP位点,可以对任何一种家养犬类进行全基因组扫描。

此外,Illumina的植物全基因组SNP芯片服务还包括了玉米、甘蓝、樱桃、桃子、大豆、辣椒、小麦、苹果、葡萄、燕麦、番茄、小麦、大麦、马铃薯、向日葵、棉花、水稻和豆类等物种。其中,玉米芯片名称为Maize SNP50 BeadChip,包含了56,110个玉米SNP位点;甘蓝芯片名称为Intl Brassica SNP Consortium,包含了52,157个甘蓝SNP位点。其他植物品种也都有自己的芯片名称。

主要参考资料

[1] Illumina芯片服务平台介绍

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甲酰胺嘧啶-DNA糖基化酶的特点是什么? 1

Escherichiacoli中存在着一类特异识别 8-羟基鸟嘌呤的修复酶:甲酰胺嘧啶 -DNA糖基化酶,这类酶可以将 8-羟基鸟嘌呤从DNA中清除,以保证细胞遗传信息的稳定性,人与Sacharomycescerevisiae同样存在这类修复酶。Fpg (formamidopyrimidine [fapy]-DNA glycosylase,甲酰胺嘧啶 [fapy]-DNA 糖基化酶)也称作 8-氧代鸟嘌呤 DNA 糖基化酶、甲酰胺嘧啶-DNA糖基化酶(Fpg),既有 N-端糖基化酶活性也有 AP-裂解酶活性。N-端糖基化酶活性可以切下双链 DNA 上受损的嘌呤碱基,产生一个脱嘌呤(AP)位点。AP-裂解酶活性可以切割 AP 位点的 3´ 或 5´ 端,因此可以除去 AP 位点,产生一个具有 3´ 和 5´ 磷酸的碱基缺口。被 Fpg 识别并切除的受损碱基包括:7,8-二羟基-8-氧代鸟嘌呤(8-氧代鸟嘌呤)、8-羟基腺嘌呤、fapy-鸟嘌呤、甲基-fapy-鸟嘌呤、fapy-腺嘌呤、黄曲霉毒素 B1-fapy-鸟嘌呤、5-羟基-胞嘧啶和 5-羟基尿嘧啶。

甲酰胺嘧啶-DNA糖基化酶的特点

甲酰胺嘧啶-DNA糖基化酶(Fpg)具体有下列特点:

1. 单细胞凝胶电泳 (彗星试验),彗星试验的推荐稀释倍数,1:103~1:104

2. 碱性析出

3. 碱解旋

4. 修饰的切刻平移技术

甲酰胺嘧啶-DNA糖基化酶的组分

名称

数量

Fpg (8 U/μl)

100 μl/500 μl

10X Fpg Reaction Buffer

1 ml/1 ml×2

甲酰胺嘧啶-DNA糖基化酶的应用

甲酰胺嘧啶-DNA糖基化酶的应用包括:

单细胞凝胶电泳;

DNA损伤和修复研究;

SNP分析。

甲酰胺嘧啶-DNA糖基化酶的单位定义

1 单位指在 10 μl 反应体系中,37℃条件下, 1 小时内能够切割 1 pmol 含单个与胞嘧啶配对的 8-氧代鸟嘌呤的 34 bp 寡核苷酸双链所需要的酶量定义为一个活性单位。

甲酰胺嘧啶-DNA糖基化酶的反应条件

甲酰胺嘧啶-DNA糖基化酶的反应条件为:10 mM Bis-Tris(pH 7.0),10 mM MgCl2 ,1mM DTT, 100 μg/ml BSA,37℃ 温育

甲酰胺嘧啶-DNA糖基化酶的储存液

甲酰胺嘧啶-DNA糖基化酶的储存液为:50 mM Tris-HCl (pH 8.0), 50 mM KCl, 1 mM DTT, 50% Glycerol.

甲酰胺嘧啶-DNA糖基化酶的热失活

甲酰胺嘧啶-DNA糖基化酶的热失活温度为60°C,时间为10分钟。

甲酰胺嘧啶-DNA糖基化酶的储存

甲酰胺嘧啶-DNA糖基化酶应置于-20°C可保存2年,避免反复冻融。

主要参考文献

[1] 张海涛, 祝其锋. 细胞中特异识别 8—羟基鸟嘌呤的修复酶[D]. , 2001.

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Escherichiacoli中存在着一类特异识别 8-羟基鸟嘌呤的修复酶:甲酰胺嘧啶 -DNA糖基化酶,这类酶可以将 8-羟基鸟嘌呤从DNA中清除,以保证细胞遗传信息的稳定性,人与Sacharomycescerevisiae同样存在这类修复酶。Fpg (formamidopyrimidine [fapy]-DNA glycosylase,甲酰胺嘧啶 [fapy]-DNA 糖基化酶)也称作 8-氧代鸟嘌呤 DNA 糖基化酶、甲酰胺嘧啶-DNA糖基化酶(Fpg),既有 N-端糖基化酶活性也有 AP-裂解酶活性。N-端糖基化酶活性可以切下双链 DNA 上受损的嘌呤碱基,产生一个脱嘌呤(AP)位点。AP-裂解酶活性可以切割 AP 位点的 3´ 或 5´ 端,因此可以除去 AP 位点,产生一个具有 3´ 和 5´ 磷酸的碱基缺口。被 Fpg 识别并切除的受损碱基包括:7,8-二羟基-8-氧代鸟嘌呤(8-氧代鸟嘌呤)、8-羟基腺嘌呤、fapy-鸟嘌呤、甲基-fapy-鸟嘌呤、fapy-腺嘌呤、黄曲霉毒素 B1-fapy-鸟嘌呤、5-羟基-胞嘧啶和 5-羟基尿嘧啶。

甲酰胺嘧啶-DNA糖基化酶的特点

甲酰胺嘧啶-DNA糖基化酶(Fpg)具体有下列特点:

1. 单细胞凝胶电泳 (彗星试验),彗星试验的推荐稀释倍数,1:103~1:104

2. 碱性析出

3. 碱解旋

4. 修饰的切刻平移技术

甲酰胺嘧啶-DNA糖基化酶的组分

名称

数量

Fpg (8 U/μl)

100 μl/500 μl

10X Fpg Reaction Buffer

1 ml/1 ml×2

甲酰胺嘧啶-DNA糖基化酶的应用

甲酰胺嘧啶-DNA糖基化酶的应用包括:

单细胞凝胶电泳;

DNA损伤和修复研究;

SNP分析。

甲酰胺嘧啶-DNA糖基化酶的单位定义

1 单位指在 10 μl 反应体系中,37℃条件下, 1 小时内能够切割 1 pmol 含单个与胞嘧啶配对的 8-氧代鸟嘌呤的 34 bp 寡核苷酸双链所需要的酶量定义为一个活性单位。

甲酰胺嘧啶-DNA糖基化酶的反应条件

甲酰胺嘧啶-DNA糖基化酶的反应条件为:10 mM Bis-Tris(pH 7.0),10 mM MgCl2 ,1mM DTT, 100 μg/ml BSA,37℃ 温育

甲酰胺嘧啶-DNA糖基化酶的储存液

甲酰胺嘧啶-DNA糖基化酶的储存液为:50 mM Tris-HCl (pH 8.0), 50 mM KCl, 1 mM DTT, 50% Glycerol.

甲酰胺嘧啶-DNA糖基化酶的热失活

甲酰胺嘧啶-DNA糖基化酶的热失活温度为60°C,时间为10分钟。

甲酰胺嘧啶-DNA糖基化酶的储存

甲酰胺嘧啶-DNA糖基化酶应置于-20°C可保存2年,避免反复冻融。

主要参考文献

[1] 张海涛, 祝其锋. 细胞中特异识别 8—羟基鸟嘌呤的修复酶[D]. , 2001.

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如何应用T4噬菌体基因32编码蛋白进行DNA研究? 1

T4噬菌体基因32编码蛋白(T4 gene 32 protein)是一种重要的单链DNA(ssDNA)结合蛋白,它在T4噬菌体DNA复制和修复过程中起着关键的作用。除了在DNA复制中的结构性功能外,该蛋白还可以用于稳定和标记ssDNA区域,以便进行电子显微镜观察。最新研究还发现,T4噬菌体基因32编码蛋白还具有促进限制性内切酶消化反应、提高RT-PCR反转录效率、增强T4 DNA聚合酶活性和增加PCR产量的能力。

组分

应用

T4噬菌体基因32编码蛋白可用于稳定和标记ssDNA结构,提高PCR产物的产量,增加RT-PCR反转录的产量和延伸能力。此外,在土壤样品PCR中,它还能增加目的片段的产量和特异性。

产品特点

1. 高效:以λDNA为模板,扩增长度可达8kb,能高效扩增≤4kb片段。

2. 灵敏:可从0.05ng人基因组DNA模板中扩增出特定基因片段。

3. 高品质:完全满足Real Time PCR实验要求。

4. 独特配方的5×Buffer:使PCR扩增反应更加稳定、灵敏、高效。

储存

-20℃可保存3年。

使用注意事项

(1)该蛋白分子量为33kD。

(2)该蛋白保存液含50%甘油。

(3)该蛋白的最佳反应温度为37℃,65℃ 20min可使该蛋白失活。

质量保证

经多次柱纯化,SDS-PAGE胶检测仅可见清晰单一的目的条带;PCR方法检测无大肠杆菌DNA残留,无核酸内、外切酶污染。每批产品均通过检测与单链引物结合后其涌动率的改变来检测其活性。

使用建议

反应体系,1X Reaction Buffer,37°C温育

主要参考文献

[1] 邢玉华, 谭俊杰, 李玉霞, 等. 合成生物学的关键技术及应用进展[J]. 中国医药生物技术, 2012, 7(5): 357-363. 显示全部

T4噬菌体基因32编码蛋白(T4 gene 32 protein)是一种重要的单链DNA(ssDNA)结合蛋白,它在T4噬菌体DNA复制和修复过程中起着关键的作用。除了在DNA复制中的结构性功能外,该蛋白还可以用于稳定和标记ssDNA区域,以便进行电子显微镜观察。最新研究还发现,T4噬菌体基因32编码蛋白还具有促进限制性内切酶消化反应、提高RT-PCR反转录效率、增强T4 DNA聚合酶活性和增加PCR产量的能力。

组分

应用

T4噬菌体基因32编码蛋白可用于稳定和标记ssDNA结构,提高PCR产物的产量,增加RT-PCR反转录的产量和延伸能力。此外,在土壤样品PCR中,它还能增加目的片段的产量和特异性。

产品特点

1. 高效:以λDNA为模板,扩增长度可达8kb,能高效扩增≤4kb片段。

2. 灵敏:可从0.05ng人基因组DNA模板中扩增出特定基因片段。

3. 高品质:完全满足Real Time PCR实验要求。

4. 独特配方的5×Buffer:使PCR扩增反应更加稳定、灵敏、高效。

储存

-20℃可保存3年。

使用注意事项

(1)该蛋白分子量为33kD。

(2)该蛋白保存液含50%甘油。

(3)该蛋白的最佳反应温度为37℃,65℃ 20min可使该蛋白失活。

质量保证

经多次柱纯化,SDS-PAGE胶检测仅可见清晰单一的目的条带;PCR方法检测无大肠杆菌DNA残留,无核酸内、外切酶污染。每批产品均通过检测与单链引物结合后其涌动率的改变来检测其活性。

使用建议

反应体系,1X Reaction Buffer,37°C温育

主要参考文献

[1] 邢玉华, 谭俊杰, 李玉霞, 等. 合成生物学的关键技术及应用进展[J]. 中国医药生物技术, 2012, 7(5): 357-363.

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临床肿瘤学综合科研服务中的哪些项目可以帮助研究细胞特性? 1

临床肿瘤学综合科研服务提供多种基础和拓展项目,以帮助研究细胞特性。其中基础服务项目包括克隆形成能力检测、细胞增殖检测、细胞凋亡检测和细胞周期检测。拓展服务项目则包括细胞迁移和细胞侵袭等。

克隆形成能力检测是一种有效的方法,用于检测细胞群体依赖性和增殖能力特性。通过对克隆形成的计数,可以定量分析细胞的增殖潜力,了解其增殖能力和独立生存能力。

细胞周期检测用于检测连续分裂的细胞从一次分裂到下一次分裂的周期。细胞周期可分为分裂间期(G)和有丝分裂期(M)。分裂间期又可分为G1期、S期和G2期。有丝分裂期可分为前、中、后和末四个时期。通过细胞周期检测,可以了解细胞在不同阶段的状态和活动。

细胞凋亡检测用于检测细胞在特定信号诱导下发生的程序性死亡过程。细胞凋亡的特征包括核染色质凝聚和外周化、细胞质减少和致密化、内质网与细胞膜融合等。细胞凋亡是一种主动生理过程,对营养素和生物活性物质的摄入有重要影响。

细胞增殖检测用于检测细胞生长、DNA复制和细胞分裂过程中细胞数目的增加。细胞增殖方式包括无丝分裂、有丝分裂和减数分裂。无丝分裂是一种快速、耗能少且时间短的分裂方式,有丝分裂是真核细胞主要的分裂方式,减数分裂是染色体数目减半的有丝分裂。细胞增殖周期可分为G1、S、G2和M四个时期。

主要参考资料

[1] 教师百科辞典

[2] 营养科学词典

[3] 卫生学大辞典

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临床肿瘤学综合科研服务提供多种基础和拓展项目,以帮助研究细胞特性。其中基础服务项目包括克隆形成能力检测、细胞增殖检测、细胞凋亡检测和细胞周期检测。拓展服务项目则包括细胞迁移和细胞侵袭等。

克隆形成能力检测是一种有效的方法,用于检测细胞群体依赖性和增殖能力特性。通过对克隆形成的计数,可以定量分析细胞的增殖潜力,了解其增殖能力和独立生存能力。

细胞周期检测用于检测连续分裂的细胞从一次分裂到下一次分裂的周期。细胞周期可分为分裂间期(G)和有丝分裂期(M)。分裂间期又可分为G1期、S期和G2期。有丝分裂期可分为前、中、后和末四个时期。通过细胞周期检测,可以了解细胞在不同阶段的状态和活动。

细胞凋亡检测用于检测细胞在特定信号诱导下发生的程序性死亡过程。细胞凋亡的特征包括核染色质凝聚和外周化、细胞质减少和致密化、内质网与细胞膜融合等。细胞凋亡是一种主动生理过程,对营养素和生物活性物质的摄入有重要影响。

细胞增殖检测用于检测细胞生长、DNA复制和细胞分裂过程中细胞数目的增加。细胞增殖方式包括无丝分裂、有丝分裂和减数分裂。无丝分裂是一种快速、耗能少且时间短的分裂方式,有丝分裂是真核细胞主要的分裂方式,减数分裂是染色体数目减半的有丝分裂。细胞增殖周期可分为G1、S、G2和M四个时期。

主要参考资料

[1] 教师百科辞典

[2] 营养科学词典

[3] 卫生学大辞典

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原核微生物转录组测序的应用及分析内容? 1

原核微生物转录组测序是利用高通量测序技术对原核生物的转录本进行测序,以获取特定微生物在特定状态下的转录本信息。该技术可以揭示微生物分子调控机制,为基因网络调控研究提供支撑。

转录组测序的应用

案例一:地中海拟无枝酸菌U32产生利福霉素的分子机制

通过转录组测序研究,揭示了地中海拟无枝酸菌在硝酸盐培养条件下利福霉素生物合成途径的转录水平变化。研究结果表明,硝酸盐通过前体供应促进利福霉素生物合成酶途径,从而刺激利福霉素的产生。

案例二:保加利亚乳酸杆菌的转录组研究

利用链特异性转录组测序,研究人员探究了保加利亚乳酸杆菌不同生长阶段的转录表达情况。研究结果发现,基因表达与生长阶段呈高度相关性,并揭示了该菌株具有高效的氮源利用系统。此研究为保加利亚乳酸杆菌在工业上的应用提供了基础。

主要参考资料

[1] Shao Z H, Ren S X, Liu X Q, et al. A preliminary study of the mechanism of nitrate-stimulated remarkable increase of rifamycin production in Amycolatopsis mediterranei U32 by RNA-seq[J]. Microbial cell factories, 2015, 14(1): 75.

[2] Zheng H, Liu E, Shi T, et al. Strand-specific RNA-seq analysis of the Lactobacillus delbrueckii subsp. bulgaricus transcriptome[J]. Molecular BioSystems, 2016, 12(2): 508-519.

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原核微生物转录组测序是利用高通量测序技术对原核生物的转录本进行测序,以获取特定微生物在特定状态下的转录本信息。该技术可以揭示微生物分子调控机制,为基因网络调控研究提供支撑。

转录组测序的应用

案例一:地中海拟无枝酸菌U32产生利福霉素的分子机制

通过转录组测序研究,揭示了地中海拟无枝酸菌在硝酸盐培养条件下利福霉素生物合成途径的转录水平变化。研究结果表明,硝酸盐通过前体供应促进利福霉素生物合成酶途径,从而刺激利福霉素的产生。

案例二:保加利亚乳酸杆菌的转录组研究

利用链特异性转录组测序,研究人员探究了保加利亚乳酸杆菌不同生长阶段的转录表达情况。研究结果发现,基因表达与生长阶段呈高度相关性,并揭示了该菌株具有高效的氮源利用系统。此研究为保加利亚乳酸杆菌在工业上的应用提供了基础。

主要参考资料

[1] Shao Z H, Ren S X, Liu X Q, et al. A preliminary study of the mechanism of nitrate-stimulated remarkable increase of rifamycin production in Amycolatopsis mediterranei U32 by RNA-seq[J]. Microbial cell factories, 2015, 14(1): 75.

[2] Zheng H, Liu E, Shi T, et al. Strand-specific RNA-seq analysis of the Lactobacillus delbrueckii subsp. bulgaricus transcriptome[J]. Molecular BioSystems, 2016, 12(2): 508-519.

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全基因组甲基化测序在肿瘤微环境研究中的应用? 1

全基因组甲基化测序(WGBS)是一种被广泛应用的甲基化测序技术,被认为是甲基化测序的"金标准"。该技术通过使用Bisulfite处理,将未甲基化的C碱基转换为U,经过PCR扩增后变为T,从而与已甲基化的C碱基区分开来。结合高通量测序技术和参考序列比对,可以确定CpG/CHG/CHH位点的甲基化状态,特别适用于绘制单碱基分辨率的全基因组DNA甲基化图谱。

肿瘤微环境表观遗传特征谱的绘制

肿瘤的发生和发展涉及肿瘤上皮细胞与其微环境之间的动态互作。目前,大部分关于肿瘤的表观基因组研究集中于上皮肿瘤细胞,而对于维持肿瘤表型的肿瘤微环境的分子特征研究较少。肿瘤相关成纤维细胞(CAF)是肿瘤微环境中的重要组成部分,可以促进肿瘤细胞的迁移和增殖。然而,关于CAF的表观基因组特征谱尚不清楚。

研究内容和结果

本研究利用WGBS技术对肿瘤相关成纤维细胞CAF和非恶性前列腺成纤维细胞NPF进行甲基化检测,并筛选出两者之间的差异甲基化区域DMR,并进行了DMR的注释。研究结果显示,CAF中的DMR富集在基因调控区域,与RNAseq的联合分析证明这些DMR对基因的转录产生调控作用。此外,CAF中的DMR基因注释结果显示,这些DMR富集在与肿瘤相关的信号通路中。筛选出的这些DMR可以用于前列腺癌的诊断。

   

参考文献

[1] Pidsley R, Lawrence MG, Zotenko E, et al. Enduring epigenetic landmarks define the cancer microenvironment. Genome Res 2018; 28(5): 625-638. (IF: 10.101) 显示全部

全基因组甲基化测序(WGBS)是一种被广泛应用的甲基化测序技术,被认为是甲基化测序的"金标准"。该技术通过使用Bisulfite处理,将未甲基化的C碱基转换为U,经过PCR扩增后变为T,从而与已甲基化的C碱基区分开来。结合高通量测序技术和参考序列比对,可以确定CpG/CHG/CHH位点的甲基化状态,特别适用于绘制单碱基分辨率的全基因组DNA甲基化图谱。

肿瘤微环境表观遗传特征谱的绘制

肿瘤的发生和发展涉及肿瘤上皮细胞与其微环境之间的动态互作。目前,大部分关于肿瘤的表观基因组研究集中于上皮肿瘤细胞,而对于维持肿瘤表型的肿瘤微环境的分子特征研究较少。肿瘤相关成纤维细胞(CAF)是肿瘤微环境中的重要组成部分,可以促进肿瘤细胞的迁移和增殖。然而,关于CAF的表观基因组特征谱尚不清楚。

研究内容和结果

本研究利用WGBS技术对肿瘤相关成纤维细胞CAF和非恶性前列腺成纤维细胞NPF进行甲基化检测,并筛选出两者之间的差异甲基化区域DMR,并进行了DMR的注释。研究结果显示,CAF中的DMR富集在基因调控区域,与RNAseq的联合分析证明这些DMR对基因的转录产生调控作用。此外,CAF中的DMR基因注释结果显示,这些DMR富集在与肿瘤相关的信号通路中。筛选出的这些DMR可以用于前列腺癌的诊断。

   

参考文献

[1] Pidsley R, Lawrence MG, Zotenko E, et al. Enduring epigenetic landmarks define the cancer microenvironment. Genome Res 2018; 28(5): 625-638. (IF: 10.101)

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如何培养和保存COS-7/非洲绿猴SV40转化的肾细胞? 1

CV-1细胞株经过带有编码野生型T抗原的起始失活突变的SV40转染,得到了COS-7/非洲绿猴SV40转化的肾细胞。为了传代这些细胞,建议使用1:2~1:3的传代比例,每2~3天更换一次培养液。确保细胞质检情况良好,没有细菌、真菌、支原体等微生物污染。

如果需要冷冻和保存COS-7/非洲绿猴SV40转化的肾细胞,有以下方法:

1)使用干冰运输,收到后立即转入液氮冻存或直接复苏。

2)对于存活的细胞,收到后应继续生长,传代达到细胞生长状态良好时,再进行冻存。

下面是COS-7/非洲绿猴SV40转化的肾细胞的培养方法:

1)将细胞稀释到1000个细胞/mL,接种到24孔板,每孔1ml。

2)接种后第二天在100ug/mL~1mg/mL的G418浓度范围内进行筛选。

3)每隔3天更换1次培养液,保持G418浓度不变。

4)选择出在10~14天内使COS-7非洲绿猴SV40转化的肾细胞全部死亡的最低G418浓度来进行下一步的筛选试验。由于每种细胞对G418的敏感性不同,一般变动在100ug/ml~1000ug/ml范围。

有研究构建了人β防御素-1(hBD-1)稳定表达细胞株,并检测表达产物人p防御素-1对多种多重耐药菌的抗菌活性。方法是将重组质粒pCMV-hBDl通过阳离子脂质体转染于COS-7非洲绿猴SV40转化的肾细胞,经过G418压力筛选后获得单克隆细胞株;提取细胞总RNA,RT-PCR检测目的基因在转录水平的表达;收集细胞培养上清液,Westernblotting检测hBDl基因蛋白的表达;将含有表达产物hBDl的细胞培养上清液分别同各耐药菌液混合,37℃孵育不同时间后涂布于LB平板,以各实验组和对照组的菌落数的比值作为该耐药菌的存活率。

主要参考资料

[1]hBD1稳定表达细胞株的建立及其表达产物对多重耐药菌的活性检测

显示全部

CV-1细胞株经过带有编码野生型T抗原的起始失活突变的SV40转染,得到了COS-7/非洲绿猴SV40转化的肾细胞。为了传代这些细胞,建议使用1:2~1:3的传代比例,每2~3天更换一次培养液。确保细胞质检情况良好,没有细菌、真菌、支原体等微生物污染。

如果需要冷冻和保存COS-7/非洲绿猴SV40转化的肾细胞,有以下方法:

1)使用干冰运输,收到后立即转入液氮冻存或直接复苏。

2)对于存活的细胞,收到后应继续生长,传代达到细胞生长状态良好时,再进行冻存。

下面是COS-7/非洲绿猴SV40转化的肾细胞的培养方法:

1)将细胞稀释到1000个细胞/mL,接种到24孔板,每孔1ml。

2)接种后第二天在100ug/mL~1mg/mL的G418浓度范围内进行筛选。

3)每隔3天更换1次培养液,保持G418浓度不变。

4)选择出在10~14天内使COS-7非洲绿猴SV40转化的肾细胞全部死亡的最低G418浓度来进行下一步的筛选试验。由于每种细胞对G418的敏感性不同,一般变动在100ug/ml~1000ug/ml范围。

有研究构建了人β防御素-1(hBD-1)稳定表达细胞株,并检测表达产物人p防御素-1对多种多重耐药菌的抗菌活性。方法是将重组质粒pCMV-hBDl通过阳离子脂质体转染于COS-7非洲绿猴SV40转化的肾细胞,经过G418压力筛选后获得单克隆细胞株;提取细胞总RNA,RT-PCR检测目的基因在转录水平的表达;收集细胞培养上清液,Westernblotting检测hBDl基因蛋白的表达;将含有表达产物hBDl的细胞培养上清液分别同各耐药菌液混合,37℃孵育不同时间后涂布于LB平板,以各实验组和对照组的菌落数的比值作为该耐药菌的存活率。

主要参考资料

[1]hBD1稳定表达细胞株的建立及其表达产物对多重耐药菌的活性检测

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结肠腺癌细胞的增殖和凋亡受到哪些因素的影响? 1

结肠腺癌是一种恶性肿瘤,发生于结肠粘膜上皮。该肿瘤的特点是癌细胞形成不规则的腺样结构,排列紊乱。COLO320/人结肠腺癌细胞是一种用于科学研究的细胞株,来源于美国ATCC原代细胞和国内实验室传代细胞。本研究旨在探究选择性环氧合酶-2(COX-2)抑制剂尼美舒利对COLO320/人结肠腺癌细胞增殖和凋亡的影响及机制。通过MTT法检测不同浓度尼美舒利处理后的细胞增殖率,通过流式细胞术检测细胞凋亡率,通过RT-PCR和WesternBlot法检测COX-2、Bcl-2和VEGF的mRNA和蛋白表达率。

结果显示,经过不同浓度尼美舒利处理后,COLO320/人结肠腺癌细胞的增殖率和凋亡率呈现不同程度的变化。药物处理后的细胞中COX-2的mRNA和蛋白表达在各组间无统计学差异,而Bcl-2和VEGF的mRNA和蛋白表达在高浓度组较低浓度组和对照组明显降低。因此,尼美舒利可能通过下调抗凋亡因子Bcl-2和血管内皮生成因子VEGF的表达来抑制COLO320/人结肠腺癌细胞的增殖并诱导凋亡。此外,还有实验观察金雀异黄素和5-氟脲嘧啶合用对COLO320/人结肠腺癌细胞的相互作用。结果显示,两种药物单独应用时随着剂量增加,其效应增加;而合用时,大剂量时具有拮抗作用,小剂量时具有协同作用。此外,给药时间和给药顺序也会影响效应的大小。

主要参考资料

[1] 病理学实验彩色图谱

[2] 金雀异黄素和5-FU对人结肠癌细胞株(Colo320)的相互作用的体外观察

[3] 尼美舒利抑制结肠腺癌细胞Colo-320增殖凋亡机制研究 显示全部

结肠腺癌是一种恶性肿瘤,发生于结肠粘膜上皮。该肿瘤的特点是癌细胞形成不规则的腺样结构,排列紊乱。COLO320/人结肠腺癌细胞是一种用于科学研究的细胞株,来源于美国ATCC原代细胞和国内实验室传代细胞。本研究旨在探究选择性环氧合酶-2(COX-2)抑制剂尼美舒利对COLO320/人结肠腺癌细胞增殖和凋亡的影响及机制。通过MTT法检测不同浓度尼美舒利处理后的细胞增殖率,通过流式细胞术检测细胞凋亡率,通过RT-PCR和WesternBlot法检测COX-2、Bcl-2和VEGF的mRNA和蛋白表达率。

结果显示,经过不同浓度尼美舒利处理后,COLO320/人结肠腺癌细胞的增殖率和凋亡率呈现不同程度的变化。药物处理后的细胞中COX-2的mRNA和蛋白表达在各组间无统计学差异,而Bcl-2和VEGF的mRNA和蛋白表达在高浓度组较低浓度组和对照组明显降低。因此,尼美舒利可能通过下调抗凋亡因子Bcl-2和血管内皮生成因子VEGF的表达来抑制COLO320/人结肠腺癌细胞的增殖并诱导凋亡。此外,还有实验观察金雀异黄素和5-氟脲嘧啶合用对COLO320/人结肠腺癌细胞的相互作用。结果显示,两种药物单独应用时随着剂量增加,其效应增加;而合用时,大剂量时具有拮抗作用,小剂量时具有协同作用。此外,给药时间和给药顺序也会影响效应的大小。

主要参考资料

[1] 病理学实验彩色图谱

[2] 金雀异黄素和5-FU对人结肠癌细胞株(Colo320)的相互作用的体外观察

[3] 尼美舒利抑制结肠腺癌细胞Colo-320增殖凋亡机制研究

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黄芪多糖对COLO205/人结肠癌细胞的影响? 1

结肠癌是一种恶性肿瘤,起源于结肠黏膜。它通常发生在中年人,尤其好发于乙状结肠。结肠癌可以根据大体形态分为肿块型、溃疡型和浸润型,组织学上则分为腺癌、黏液癌、未分化癌、鳞腺癌和鳞状细胞癌。该疾病常伴有淋巴转移和血行转移,其中经门静脉至肝的血行转移最为常见。结肠癌还可以直接侵犯邻近的组织和器官。右半结肠癌的主要表现是贫血、慢性中毒症状和腹部肿块,而左半结肠癌则以肠梗阻、排便紊乱和便血为特点。诊断结肠癌常常需要进行钡灌肠和结肠镜检查,CT扫描可以观察肿瘤与邻近结构的关系。一般来说,手术治疗是常用的治疗方法。

COLO205/人结肠癌细胞是从一名70岁男性白人的腹水中分离出来的。该病人在取腹水样品前已经接受了5-氟尿嘧啶治疗4~6周。角蛋白免疫过氧化物酶染色结果呈阳性。

COLO205/人结肠癌细胞的传代建议是1:2~1:3传代,每2~3天更换培养液一次。细胞质检查结果显示不含细菌、真菌、支原体等微生物污染。COLO205/人结肠癌细胞仅用于科学研究,不得用于人或动物,也不得用于临床诊断。

一项实验研究探讨了黄芪多糖对COLO205/人结肠癌细胞增殖和凋亡的影响。实验使用了不同浓度的黄芪多糖(25μg/mL、50μg/mL、100μg/mL)与COLO205/人结肠癌细胞共同培养24、48、72小时。通过MTT法检测细胞增殖抑制率,通过免疫组化法检测细胞增殖核抗原(PCNA)的表达情况,通过TUNEL法检测细胞凋亡情况。结果显示,50μg/mL以上浓度的黄芪多糖对体外培养的COLO205/人结肠癌细胞生长具有抑制作用(抑制率30.0%,P0.01),并且呈现出量效和时效关系。与对照组相比,黄芪多糖处理组(50μg/mL、100μg/mL)的PCNA表达降低,细胞凋亡增加(凋亡指数31.47%,P0.01)。因此,黄芪多糖可能通过减慢COLO205/人结肠癌细胞的增殖、增加细胞凋亡和降低PCNA的表达来发挥抗肿瘤作用。

主要参考资料

[1] 中国卫生管理辞典

[2] 黄芪多糖对COLO205人结肠癌细胞株抑制作用研究

显示全部

结肠癌是一种恶性肿瘤,起源于结肠黏膜。它通常发生在中年人,尤其好发于乙状结肠。结肠癌可以根据大体形态分为肿块型、溃疡型和浸润型,组织学上则分为腺癌、黏液癌、未分化癌、鳞腺癌和鳞状细胞癌。该疾病常伴有淋巴转移和血行转移,其中经门静脉至肝的血行转移最为常见。结肠癌还可以直接侵犯邻近的组织和器官。右半结肠癌的主要表现是贫血、慢性中毒症状和腹部肿块,而左半结肠癌则以肠梗阻、排便紊乱和便血为特点。诊断结肠癌常常需要进行钡灌肠和结肠镜检查,CT扫描可以观察肿瘤与邻近结构的关系。一般来说,手术治疗是常用的治疗方法。

COLO205/人结肠癌细胞是从一名70岁男性白人的腹水中分离出来的。该病人在取腹水样品前已经接受了5-氟尿嘧啶治疗4~6周。角蛋白免疫过氧化物酶染色结果呈阳性。

COLO205/人结肠癌细胞的传代建议是1:2~1:3传代,每2~3天更换培养液一次。细胞质检查结果显示不含细菌、真菌、支原体等微生物污染。COLO205/人结肠癌细胞仅用于科学研究,不得用于人或动物,也不得用于临床诊断。

一项实验研究探讨了黄芪多糖对COLO205/人结肠癌细胞增殖和凋亡的影响。实验使用了不同浓度的黄芪多糖(25μg/mL、50μg/mL、100μg/mL)与COLO205/人结肠癌细胞共同培养24、48、72小时。通过MTT法检测细胞增殖抑制率,通过免疫组化法检测细胞增殖核抗原(PCNA)的表达情况,通过TUNEL法检测细胞凋亡情况。结果显示,50μg/mL以上浓度的黄芪多糖对体外培养的COLO205/人结肠癌细胞生长具有抑制作用(抑制率30.0%,P0.01),并且呈现出量效和时效关系。与对照组相比,黄芪多糖处理组(50μg/mL、100μg/mL)的PCNA表达降低,细胞凋亡增加(凋亡指数31.47%,P0.01)。因此,黄芪多糖可能通过减慢COLO205/人结肠癌细胞的增殖、增加细胞凋亡和降低PCNA的表达来发挥抗肿瘤作用。

主要参考资料

[1] 中国卫生管理辞典

[2] 黄芪多糖对COLO205人结肠癌细胞株抑制作用研究

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金粉蕨素对卵巢癌细胞的作用及机制研究? 1

CHO-K1/仓鼠卵巢细胞亚株是从中国仓鼠卵巢组织中分离出的CHO细胞的亚克隆。该细胞亚株主要来源于多个国际知名研究机构和大学。研究人员探讨了金粉蕨素对人卵巢癌细胞系(COC1)的作用及其机制。通过MTT比色法和PI染色流式细胞术分析了金粉蕨素对COC1、顺铂耐药亚株COC1/DDP以及中国CHO-K1/仓鼠卵巢细胞亚株的增殖、凋亡和细胞周期的影响。结果显示金粉蕨素能抑制COC1和COC1/DDP细胞的生长,并使COC1细胞周期停滞于G1期。

研究还致力于构建含有hFⅦ-LC+hIgG1-Fc cDNA的重组真核表达载体,并将其转染到中国CHO-K1/仓鼠卵巢细胞亚株中,以获得针对组织因子(TF)的免疫治疗结合物,用于肿瘤的靶向治疗。此外,研究人员还通过N-甲基-N'-硝基-N-亚硝基胍(MNNG)诱变和6-巯基鸟嘌呤(6-TG)选择的方法,得到了稳定的次黄嘌呤磷酸核糖转移酶(HPRT)缺陷细胞株。通过磷酸钙共沉淀法和电脉冲法将人宫颈癌细胞(HeLaS_3)的基因组DNA转移到HPRT-细胞中,成功纠正了CHO-K1/仓鼠卵巢细胞亚株的HPRT缺陷。经过连续传代,研究人员证实人的DNA序列已稳定地整合到CHO-K1/仓鼠卵巢细胞亚株的染色体中。

主要参考资料

[1] 金粉蕨素体外抗人卵巢癌作用研究

[2] 以组织因子为靶点的肿瘤免疫治疗结合物的合成及其对结直肠癌细胞的影响

[3] 用人DNA介导的基因转移修复中国仓鼠细胞的HPRT缺陷

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CHO-K1/仓鼠卵巢细胞亚株是从中国仓鼠卵巢组织中分离出的CHO细胞的亚克隆。该细胞亚株主要来源于多个国际知名研究机构和大学。研究人员探讨了金粉蕨素对人卵巢癌细胞系(COC1)的作用及其机制。通过MTT比色法和PI染色流式细胞术分析了金粉蕨素对COC1、顺铂耐药亚株COC1/DDP以及中国CHO-K1/仓鼠卵巢细胞亚株的增殖、凋亡和细胞周期的影响。结果显示金粉蕨素能抑制COC1和COC1/DDP细胞的生长,并使COC1细胞周期停滞于G1期。

研究还致力于构建含有hFⅦ-LC+hIgG1-Fc cDNA的重组真核表达载体,并将其转染到中国CHO-K1/仓鼠卵巢细胞亚株中,以获得针对组织因子(TF)的免疫治疗结合物,用于肿瘤的靶向治疗。此外,研究人员还通过N-甲基-N'-硝基-N-亚硝基胍(MNNG)诱变和6-巯基鸟嘌呤(6-TG)选择的方法,得到了稳定的次黄嘌呤磷酸核糖转移酶(HPRT)缺陷细胞株。通过磷酸钙共沉淀法和电脉冲法将人宫颈癌细胞(HeLaS_3)的基因组DNA转移到HPRT-细胞中,成功纠正了CHO-K1/仓鼠卵巢细胞亚株的HPRT缺陷。经过连续传代,研究人员证实人的DNA序列已稳定地整合到CHO-K1/仓鼠卵巢细胞亚株的染色体中。

主要参考资料

[1] 金粉蕨素体外抗人卵巢癌作用研究

[2] 以组织因子为靶点的肿瘤免疫治疗结合物的合成及其对结直肠癌细胞的影响

[3] 用人DNA介导的基因转移修复中国仓鼠细胞的HPRT缺陷

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Changliver/人张氏肝细胞的起源及应用? 1

Changliver/人张氏肝细胞是从非恶性的人体组织中建立的细胞系,广泛应用于病毒学、生化和恶性肿瘤相关的转移研究。通过同工酶分析、HeLA标记染色体和DNA指纹法分析,认为Changliver/人张氏肝细胞起源于HeLa细胞污染。Changliver/人张氏肝细胞的操作说明如下:

1) 对于常温运输的细胞,收到细胞后,检查是否有运输问题,即细胞培养瓶或管是否破损,细胞培养液是否溢出。若没有运输问题,请用75%酒精消毒后,保留封口膜,放入细胞培养箱中静置。严格检查培养箱的参数:温度,湿度和CO2浓度。细胞静置时间一般为6-12小时后,细胞状态稳定后,即可开始后续操作。选用正确的细胞培养体系,按照Changliver/人张氏肝细胞的培养条件进行培养。条件允许的话,在前三天内拍照记录细胞的生长情况。

2) 对于干冰运输的细胞,请取出冷冻管后,立即放入37°C的水槽中快速解冻,轻摇冷冻管使其在1分钟内全部融化,并注意水面不可超过冷冻管盖沿,以避免污染。然后将其复苏培养,次日更换培养液。研究表明,HDACisMS-275对人胃癌细胞SGC-7901、人胃黏膜正常细胞GES-1和Changliver/人张氏肝细胞具有选择性作用,并为HDACis的临床应用提供了理论依据。通过采用不同浓度的MS-275处理SGC-7901细胞、GES-1和Changliver/人张氏肝细胞,并用WST-1方法检测药物对细胞的生长抑制作用,以及AnnexinV、PI双标流式细胞术检测MS-275对肿瘤细胞和正常细胞的选择性杀伤作用,以及TUNEL染色观察细胞核内凋亡情况,结果显示MS-275对胃癌细胞SGC-7901具有明显的生长抑制作用,并且这种作用具有时间和剂量依赖性;MS-275的杀伤作用具有选择性,对正常细胞GES-1和Changliver/人张氏肝细胞并不表现出促凋亡作用;TUNEL染色证明MS-275能诱导SGC-7901细胞核内发生DNA断裂,是细胞发生凋亡的重要指标。

主要参考资料

[1]组蛋白去乙酰化酶抑制剂MS-275在体外抑制胃癌细胞的实验研究 显示全部

Changliver/人张氏肝细胞是从非恶性的人体组织中建立的细胞系,广泛应用于病毒学、生化和恶性肿瘤相关的转移研究。通过同工酶分析、HeLA标记染色体和DNA指纹法分析,认为Changliver/人张氏肝细胞起源于HeLa细胞污染。Changliver/人张氏肝细胞的操作说明如下:

1) 对于常温运输的细胞,收到细胞后,检查是否有运输问题,即细胞培养瓶或管是否破损,细胞培养液是否溢出。若没有运输问题,请用75%酒精消毒后,保留封口膜,放入细胞培养箱中静置。严格检查培养箱的参数:温度,湿度和CO2浓度。细胞静置时间一般为6-12小时后,细胞状态稳定后,即可开始后续操作。选用正确的细胞培养体系,按照Changliver/人张氏肝细胞的培养条件进行培养。条件允许的话,在前三天内拍照记录细胞的生长情况。

2) 对于干冰运输的细胞,请取出冷冻管后,立即放入37°C的水槽中快速解冻,轻摇冷冻管使其在1分钟内全部融化,并注意水面不可超过冷冻管盖沿,以避免污染。然后将其复苏培养,次日更换培养液。研究表明,HDACisMS-275对人胃癌细胞SGC-7901、人胃黏膜正常细胞GES-1和Changliver/人张氏肝细胞具有选择性作用,并为HDACis的临床应用提供了理论依据。通过采用不同浓度的MS-275处理SGC-7901细胞、GES-1和Changliver/人张氏肝细胞,并用WST-1方法检测药物对细胞的生长抑制作用,以及AnnexinV、PI双标流式细胞术检测MS-275对肿瘤细胞和正常细胞的选择性杀伤作用,以及TUNEL染色观察细胞核内凋亡情况,结果显示MS-275对胃癌细胞SGC-7901具有明显的生长抑制作用,并且这种作用具有时间和剂量依赖性;MS-275的杀伤作用具有选择性,对正常细胞GES-1和Changliver/人张氏肝细胞并不表现出促凋亡作用;TUNEL染色证明MS-275能诱导SGC-7901细胞核内发生DNA断裂,是细胞发生凋亡的重要指标。

主要参考资料

[1]组蛋白去乙酰化酶抑制剂MS-275在体外抑制胃癌细胞的实验研究

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透明细胞性肿瘤的种类及鉴别诊断? 1

透明细胞性肿瘤是一类包括良性和恶性肿瘤的细胞病变。目前已知的良性透明细胞性肿瘤有六种,包括涎腺、乳腺、汗腺、前列腺的透明细胞肌上皮瘤,肺透明细胞瘤,卵巢透明细胞腺纤维瘤,甲状旁腺腺瘤,透明细胞型脑膜瘤、肾上腺皮质腺瘤。而恶性透明细胞性肿瘤有15种,包括甲状腺透明细胞癌、甲状旁腺腺癌、肾透明细胞癌、肺透明细胞癌、女性生殖器官苗勒源性透明细胞癌、肝透明细胞癌、乳腺透明细胞癌、乳腺富于脂质癌、胆囊和肝外胆管的透明细胞癌、肾上腺皮质腺癌、透明细胞型鳞癌、涎腺透明细胞腺癌、精原细胞瘤或无性细胞瘤、恶性肌上皮瘤、透明细胞肉瘤。鉴别诊断主要依据原发部位、特殊染色及免疫组化特点甚至超微结构特征,首先要排除其他部位的透明细胞肿瘤转移。

Caki-1/人肾透明细胞癌皮肤转移细胞的超微结构包含许多微绒毛、少许微丝、许多小线粒体、充分发育的高尔基体、内质网、许多脂滴和多层体,次级溶酶体。目前,Caki-1细胞内没有发现病毒颗粒。Caki-1/人肾透明细胞癌皮肤转移细胞的生长培养基为McCoy's5A(PM150710)+10%FBS(164210-500)+1%P/S(PB180120),细胞主要来源于ATCC、DSMZ、ECACC、RIKEN、promocell、ScienCell、ECACC、JCRB、KCLB、Asterand、ICLC以及少数国内外著名大学建系,细胞不含有HIV-1、HBV、HCV、支原体、细菌、酵母和真菌。

主要参考资料

[1] 医家金鉴•病理学卷

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透明细胞性肿瘤是一类包括良性和恶性肿瘤的细胞病变。目前已知的良性透明细胞性肿瘤有六种,包括涎腺、乳腺、汗腺、前列腺的透明细胞肌上皮瘤,肺透明细胞瘤,卵巢透明细胞腺纤维瘤,甲状旁腺腺瘤,透明细胞型脑膜瘤、肾上腺皮质腺瘤。而恶性透明细胞性肿瘤有15种,包括甲状腺透明细胞癌、甲状旁腺腺癌、肾透明细胞癌、肺透明细胞癌、女性生殖器官苗勒源性透明细胞癌、肝透明细胞癌、乳腺透明细胞癌、乳腺富于脂质癌、胆囊和肝外胆管的透明细胞癌、肾上腺皮质腺癌、透明细胞型鳞癌、涎腺透明细胞腺癌、精原细胞瘤或无性细胞瘤、恶性肌上皮瘤、透明细胞肉瘤。鉴别诊断主要依据原发部位、特殊染色及免疫组化特点甚至超微结构特征,首先要排除其他部位的透明细胞肿瘤转移。

Caki-1/人肾透明细胞癌皮肤转移细胞的超微结构包含许多微绒毛、少许微丝、许多小线粒体、充分发育的高尔基体、内质网、许多脂滴和多层体,次级溶酶体。目前,Caki-1细胞内没有发现病毒颗粒。Caki-1/人肾透明细胞癌皮肤转移细胞的生长培养基为McCoy's5A(PM150710)+10%FBS(164210-500)+1%P/S(PB180120),细胞主要来源于ATCC、DSMZ、ECACC、RIKEN、promocell、ScienCell、ECACC、JCRB、KCLB、Asterand、ICLC以及少数国内外著名大学建系,细胞不含有HIV-1、HBV、HCV、支原体、细菌、酵母和真菌。

主要参考资料

[1] 医家金鉴•病理学卷

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结肠腺癌细胞的吸收研究? 1

结肠腺癌是一种恶性肿瘤,发生于结肠粘膜上皮。该肿瘤由排列紊乱的腺样结构组成,大小和形状不一。Caco-2/人结肠腺癌细胞是一种来源于直肠原位癌的细胞系。这种细胞在培养条件下可以表现出肠上皮细胞的特征性分化。研究发现,Caco-2/人结肠腺癌细胞表达维甲酸结合蛋白I和维甲酸结合蛋白II,并呈角质蛋白阳性。在实验中,使用IMDM培养基来培养这种细胞,添加了一些必需的营养物质。有研究表明,中药化学成分盐酸黄连碱和小檗红碱可以在人肠中被吸收。

Caco-2/人结肠腺癌细胞主要用于科学研究。一些实验使用Caco-2/人结肠腺癌细胞单层模型来研究盐酸黄连碱和小檗红碱在细胞的转运过程。实验结果显示,盐酸黄连碱和小檗红碱在从绒毛面到基底面和从基底面到绒毛面两个方向的表观渗透系数分别为(1.103±0.162)×10-5,(1.309±0.102)×10-5cm.s-1。这些数值与在Caco-2/人结肠腺癌细胞单层模型上呈良好吸收的阳性对照药普萘洛尔[(2.23±0.10)×10-5cm.s-1]基本一致。因此,盐酸黄连碱和小檗红碱可以通过小肠上皮细胞被动吸收进入体内。在这两种化合物的吸收转运过程中,油/水分配系数起着关键性的作用。另外,研究还发现小檗红碱在Caco-2/人结肠腺癌细胞单层模型中可能存在外流机制。

主要参考资料

[1] 病理学实验彩色图谱

[2] 盐酸黄连碱和小檗红碱在人源Caco-2细胞单层模型中的吸收研究

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结肠腺癌是一种恶性肿瘤,发生于结肠粘膜上皮。该肿瘤由排列紊乱的腺样结构组成,大小和形状不一。Caco-2/人结肠腺癌细胞是一种来源于直肠原位癌的细胞系。这种细胞在培养条件下可以表现出肠上皮细胞的特征性分化。研究发现,Caco-2/人结肠腺癌细胞表达维甲酸结合蛋白I和维甲酸结合蛋白II,并呈角质蛋白阳性。在实验中,使用IMDM培养基来培养这种细胞,添加了一些必需的营养物质。有研究表明,中药化学成分盐酸黄连碱和小檗红碱可以在人肠中被吸收。

Caco-2/人结肠腺癌细胞主要用于科学研究。一些实验使用Caco-2/人结肠腺癌细胞单层模型来研究盐酸黄连碱和小檗红碱在细胞的转运过程。实验结果显示,盐酸黄连碱和小檗红碱在从绒毛面到基底面和从基底面到绒毛面两个方向的表观渗透系数分别为(1.103±0.162)×10-5,(1.309±0.102)×10-5cm.s-1。这些数值与在Caco-2/人结肠腺癌细胞单层模型上呈良好吸收的阳性对照药普萘洛尔[(2.23±0.10)×10-5cm.s-1]基本一致。因此,盐酸黄连碱和小檗红碱可以通过小肠上皮细胞被动吸收进入体内。在这两种化合物的吸收转运过程中,油/水分配系数起着关键性的作用。另外,研究还发现小檗红碱在Caco-2/人结肠腺癌细胞单层模型中可能存在外流机制。

主要参考资料

[1] 病理学实验彩色图谱

[2] 盐酸黄连碱和小檗红碱在人源Caco-2细胞单层模型中的吸收研究

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泛素D兔单克隆抗体的应用及其调控乳腺癌干细胞的影响? 1

泛素D兔单克隆抗体是一种用于研究泛素样蛋白D调控的抗体。它可以通过免疫组织化学染色法对乳腺癌组织进行UBD染色,并分析其表达情况。此外,实时荧光定量法可以检测乳腺癌细胞中UBD在基因水平的表达变化。细胞划痕实验和Transwell实验可以探索UBD对乳腺癌细胞侵袭转移和化疗耐药等恶性生物学行为的影响。Spheroid成球实验和实时荧光定量检测可以评估UBD分子过表达对乳腺癌细胞干性表型的调控情况。

研究结果显示,UBD在乳腺癌组织中高表达,并促进乳腺癌细胞的侵袭转移、化疗耐药性以及干性细胞群的富集和自我更新等恶性生物学过程。此外,UBD过表达还促进了乳腺癌细胞干性相关基因的表达。

背景

泛素D兔单克隆抗体是通过对兔进行系统免疫再取出脾脏细胞赛选出只分泌单一泛素D蛋白的B淋巴细胞,并与骨髓瘤细胞进行杂交制得的。泛素D是一种泛素样蛋白质修饰剂,可以共价连接到靶蛋白上,并随后以NUB1L依赖性方式导致它们被26S蛋白酶体降解。它可能是一个生存因素,具有促进蛋白酶体亚基β-9型(PSMB9/LMP2)的表达的能力。此外,它还通过促进泛素化的I-κB-α的TNF-α介导的蛋白酶体降解,调节TNF-α诱导的和LPS介导的先天免疫NF-κB中枢介质的活化。

泛素D兔单克隆抗体在肾小管上皮细胞(RTEC)中p65核转位所必需。它可能参与树突细胞(DC)成熟的过程,即未成熟树突细胞分化成启动T细胞反应的完全感受态抗原呈递细胞的过程。此外,它还在长期体外培养和癌症中介导有丝分裂不分离和染色体不稳定性中起到缩短有丝分裂期并在细胞周期的前中期阶段损害MAD2L1的动粒定位的作用。当蛋白酶体饱和或受损时,它可能参与形成聚集体,并以半胱氨酸蛋白酶依赖性方式介导细胞凋亡,尤其是在肾病,如多囊肾病和人类免疫缺陷病毒(HIV)相关性肾病(HIVAN)期间的肾上皮和肾小管细胞。

参考文献

[1] Bates EE, Ravel O, Dieu MC, Ho S, Guret C, Bridon JM, Ait-Yahia S, Brière F, Caux C, Banchereau J, Lebecque S (Oct 1997). "Identification and analysis of a novel member of the ubiquitin family expressed in dendritic cells and mature B cells". European Journal of Immunology. 27(10): 2471–7.

[2] Fan W, Cai W, Parimoo S, Schwarz DC, Lennon GG, Weissman SM (Aug 1996). "Identification of seven new human MHC class I region genes around the HLA-F locus". Immunogenetics. 44(2): 97–103.

[3] "Entrez Gene: UBD ubiquitin D".

[4] Hipp MS, Raasi S, Groettrup M, Schmidtke G (Apr 2004). "NEDD8 ultimate buster-1L interacts with the ubiquitin-like protein FAT10 and accelerates its degradation". The Journal of Biological Chemistry. 279(16): 16503–10.

[5] Liu YC, Pan J, Zhang C, Fan W, Collinge M, Bender JR, Weissman SM (Apr 1999). "A MHC-encoded ubiquitin-like protein (FAT10) binds noncovalently to the spindle assembly checkpoint protein MAD2". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 96(8): 4313–8.

[6] 韩涛, 童雅兰, 刘军灵, 张双鹤, 郭放, 刘兆喆, 谢晓冬. 泛素样蛋白D调控乳腺癌干细胞对乳腺癌生物学行为的影响[J]. 临床误诊误治, 2016, 29(04): 105-109.

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泛素D兔单克隆抗体是一种用于研究泛素样蛋白D调控的抗体。它可以通过免疫组织化学染色法对乳腺癌组织进行UBD染色,并分析其表达情况。此外,实时荧光定量法可以检测乳腺癌细胞中UBD在基因水平的表达变化。细胞划痕实验和Transwell实验可以探索UBD对乳腺癌细胞侵袭转移和化疗耐药等恶性生物学行为的影响。Spheroid成球实验和实时荧光定量检测可以评估UBD分子过表达对乳腺癌细胞干性表型的调控情况。

研究结果显示,UBD在乳腺癌组织中高表达,并促进乳腺癌细胞的侵袭转移、化疗耐药性以及干性细胞群的富集和自我更新等恶性生物学过程。此外,UBD过表达还促进了乳腺癌细胞干性相关基因的表达。

背景

泛素D兔单克隆抗体是通过对兔进行系统免疫再取出脾脏细胞赛选出只分泌单一泛素D蛋白的B淋巴细胞,并与骨髓瘤细胞进行杂交制得的。泛素D是一种泛素样蛋白质修饰剂,可以共价连接到靶蛋白上,并随后以NUB1L依赖性方式导致它们被26S蛋白酶体降解。它可能是一个生存因素,具有促进蛋白酶体亚基β-9型(PSMB9/LMP2)的表达的能力。此外,它还通过促进泛素化的I-κB-α的TNF-α介导的蛋白酶体降解,调节TNF-α诱导的和LPS介导的先天免疫NF-κB中枢介质的活化。

泛素D兔单克隆抗体在肾小管上皮细胞(RTEC)中p65核转位所必需。它可能参与树突细胞(DC)成熟的过程,即未成熟树突细胞分化成启动T细胞反应的完全感受态抗原呈递细胞的过程。此外,它还在长期体外培养和癌症中介导有丝分裂不分离和染色体不稳定性中起到缩短有丝分裂期并在细胞周期的前中期阶段损害MAD2L1的动粒定位的作用。当蛋白酶体饱和或受损时,它可能参与形成聚集体,并以半胱氨酸蛋白酶依赖性方式介导细胞凋亡,尤其是在肾病,如多囊肾病和人类免疫缺陷病毒(HIV)相关性肾病(HIVAN)期间的肾上皮和肾小管细胞。

参考文献

[1] Bates EE, Ravel O, Dieu MC, Ho S, Guret C, Bridon JM, Ait-Yahia S, Brière F, Caux C, Banchereau J, Lebecque S (Oct 1997). "Identification and analysis of a novel member of the ubiquitin family expressed in dendritic cells and mature B cells". European Journal of Immunology. 27(10): 2471–7.

[2] Fan W, Cai W, Parimoo S, Schwarz DC, Lennon GG, Weissman SM (Aug 1996). "Identification of seven new human MHC class I region genes around the HLA-F locus". Immunogenetics. 44(2): 97–103.

[3] "Entrez Gene: UBD ubiquitin D".

[4] Hipp MS, Raasi S, Groettrup M, Schmidtke G (Apr 2004). "NEDD8 ultimate buster-1L interacts with the ubiquitin-like protein FAT10 and accelerates its degradation". The Journal of Biological Chemistry. 279(16): 16503–10.

[5] Liu YC, Pan J, Zhang C, Fan W, Collinge M, Bender JR, Weissman SM (Apr 1999). "A MHC-encoded ubiquitin-like protein (FAT10) binds noncovalently to the spindle assembly checkpoint protein MAD2". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 96(8): 4313–8.

[6] 韩涛, 童雅兰, 刘军灵, 张双鹤, 郭放, 刘兆喆, 谢晓冬. 泛素样蛋白D调控乳腺癌干细胞对乳腺癌生物学行为的影响[J]. 临床误诊误治, 2016, 29(04): 105-109.

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上皮细胞的功能和研究进展? 1

上皮细胞是覆盖身体表面和体内腔面的细胞,具有明显的极性。它们有游离面和基底面,分别朝向身体表面和深部结缔组织。上皮细胞具有角质化和更新能力,对保护、吸收、分泌和排泄等功能起着重要作用。然而,当上皮细胞受损时,会影响机体的防御功能。本研究主要探讨小鼠卵巢上皮细胞的功能和转化机制。

相关研究进展

以癌基因c-myc和K-ras为研究对象,研究了它们在卵巢癌发生发展中的作用。通过逆转录病毒转基因系统,将正常的c-myc基因和突变的K-ras基因导入小鼠卵巢上皮细胞,建立了表达这些基因的细胞株。通过细胞增殖实验、克隆形成实验、体外侵袭实验和体内成瘤实验,研究了转基因后细胞的生物学特性和恶性转化。结果表明,c-myc和K-ras基因可以稳定表达在细胞内,并导致细胞增殖能力的增强和侵袭能力的提高。此外,突变的K-ras还能使细胞在体内形成肿瘤。然而,c-myc单独并不能引起细胞的恶性转化,但可以与其他因子协同作用,增强其功能。

主要参考资料

[1]儿科学辞典
[2]c-myc和K-ras对小鼠卵巢上皮细胞体外转化和体内致瘤的研究

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上皮细胞是覆盖身体表面和体内腔面的细胞,具有明显的极性。它们有游离面和基底面,分别朝向身体表面和深部结缔组织。上皮细胞具有角质化和更新能力,对保护、吸收、分泌和排泄等功能起着重要作用。然而,当上皮细胞受损时,会影响机体的防御功能。本研究主要探讨小鼠卵巢上皮细胞的功能和转化机制。

相关研究进展

以癌基因c-myc和K-ras为研究对象,研究了它们在卵巢癌发生发展中的作用。通过逆转录病毒转基因系统,将正常的c-myc基因和突变的K-ras基因导入小鼠卵巢上皮细胞,建立了表达这些基因的细胞株。通过细胞增殖实验、克隆形成实验、体外侵袭实验和体内成瘤实验,研究了转基因后细胞的生物学特性和恶性转化。结果表明,c-myc和K-ras基因可以稳定表达在细胞内,并导致细胞增殖能力的增强和侵袭能力的提高。此外,突变的K-ras还能使细胞在体内形成肿瘤。然而,c-myc单独并不能引起细胞的恶性转化,但可以与其他因子协同作用,增强其功能。

主要参考资料

[1]儿科学辞典
[2]c-myc和K-ras对小鼠卵巢上皮细胞体外转化和体内致瘤的研究

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成纤维细胞的形态结构和功能与活动状态有何关系? 1

成纤维细胞是疏松结缔组织中最常见的细胞之一,其形态结构和功能与其活动状态密切相关。在功能活动旺盛时,成纤维细胞呈扁平星形,胞核呈卵圆形,胞质内含有丰富的细胞器,表明其具有合成和分泌胶原蛋白、弹性蛋白和多糖蛋白的能力。而在功能活动不活跃时,成纤维细胞转化为纤维细胞,形态较小且轮廓不清晰,胞质内的细胞器发育不完全。然而,在创伤修复和结缔组织再生等条件下,纤维细胞可以重新转化为功能活跃的成纤维细胞,参与蛋白质的合成和分泌。

小鼠卵巢成纤维细胞是从卵巢组织中分离得到的,卵巢是雌性动物的生殖器官,其功能是产生卵子和激素。小鼠卵巢成纤维细胞具有易于培养、修复和重塑卵巢以及控制炎症扩散等特点。这些细胞经过特定的消化和贴壁方法制备而成,纯度高达90%以上,并且不含有各种病原体。

主要参考资料

[1]运动解剖学、运动医学大辞典

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成纤维细胞是疏松结缔组织中最常见的细胞之一,其形态结构和功能与其活动状态密切相关。在功能活动旺盛时,成纤维细胞呈扁平星形,胞核呈卵圆形,胞质内含有丰富的细胞器,表明其具有合成和分泌胶原蛋白、弹性蛋白和多糖蛋白的能力。而在功能活动不活跃时,成纤维细胞转化为纤维细胞,形态较小且轮廓不清晰,胞质内的细胞器发育不完全。然而,在创伤修复和结缔组织再生等条件下,纤维细胞可以重新转化为功能活跃的成纤维细胞,参与蛋白质的合成和分泌。

小鼠卵巢成纤维细胞是从卵巢组织中分离得到的,卵巢是雌性动物的生殖器官,其功能是产生卵子和激素。小鼠卵巢成纤维细胞具有易于培养、修复和重塑卵巢以及控制炎症扩散等特点。这些细胞经过特定的消化和贴壁方法制备而成,纯度高达90%以上,并且不含有各种病原体。

主要参考资料

[1]运动解剖学、运动医学大辞典

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成纤维细胞和淋巴的功能有何不同? 1

成纤维细胞是疏松结缔组织中最常见的细胞之一,其数量众多。它们位于胶原纤维附近并与其相互作用。成纤维细胞的形态结构会根据其功能状态的不同而发生变化。在功能活跃时,成纤维细胞的胞体较大,呈扁平星形,并具有突起。胞核为卵圆形,核染色质较少,呈浅色,核仁明显。胞质较多,呈弱碱性,含有丰富的粗面内质网、核蛋白体、高尔基复合体以及微丝和微管等结构。这些结构的存在表明成纤维细胞具有合成和分泌胶原蛋白、弹性蛋白和多糖蛋白的能力,从而形成胶原纤维、弹性纤维、网状纤维和基质。而在相对静止或功能不活跃时,这些细胞被称为纤维细胞。

淋巴是一种液体成分,它在淋巴管内流动。淋巴实际上是血液成分的一部分,类似于血浆,但只含有淋巴细胞。淋巴形成是血液中的液体成分通过毛细血管壁渗透到组织内,其中一部分返回毛细血管,而剩余部分进入淋巴管成为淋巴液。最后,淋巴液注入锁骨下静脉,重新进入血液循环。如果淋巴液循环受阻,就容易在组织中积聚形成象皮肿,这是一种病理表现。

小鼠淋巴成纤维细胞是从新鲜组织中提取的,不含有HIV、HBV、HCV、支原体、真菌或其他类型的细菌。小鼠淋巴成纤维细胞是通过胶原酶消化制备而成的。这些细胞的培养使用小鼠淋巴成纤维细胞培养试剂盒进行。经过10代以上的传代,小鼠淋巴成纤维细胞仍能保持原始细胞的分化状态,可用于评估体外药物模型系统和调节特定基因的遗传功能。

参考资料:

[1] 运动解剖学、运动医学大辞典

[2] 新编实用医学词典

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成纤维细胞是疏松结缔组织中最常见的细胞之一,其数量众多。它们位于胶原纤维附近并与其相互作用。成纤维细胞的形态结构会根据其功能状态的不同而发生变化。在功能活跃时,成纤维细胞的胞体较大,呈扁平星形,并具有突起。胞核为卵圆形,核染色质较少,呈浅色,核仁明显。胞质较多,呈弱碱性,含有丰富的粗面内质网、核蛋白体、高尔基复合体以及微丝和微管等结构。这些结构的存在表明成纤维细胞具有合成和分泌胶原蛋白、弹性蛋白和多糖蛋白的能力,从而形成胶原纤维、弹性纤维、网状纤维和基质。而在相对静止或功能不活跃时,这些细胞被称为纤维细胞。

淋巴是一种液体成分,它在淋巴管内流动。淋巴实际上是血液成分的一部分,类似于血浆,但只含有淋巴细胞。淋巴形成是血液中的液体成分通过毛细血管壁渗透到组织内,其中一部分返回毛细血管,而剩余部分进入淋巴管成为淋巴液。最后,淋巴液注入锁骨下静脉,重新进入血液循环。如果淋巴液循环受阻,就容易在组织中积聚形成象皮肿,这是一种病理表现。

小鼠淋巴成纤维细胞是从新鲜组织中提取的,不含有HIV、HBV、HCV、支原体、真菌或其他类型的细菌。小鼠淋巴成纤维细胞是通过胶原酶消化制备而成的。这些细胞的培养使用小鼠淋巴成纤维细胞培养试剂盒进行。经过10代以上的传代,小鼠淋巴成纤维细胞仍能保持原始细胞的分化状态,可用于评估体外药物模型系统和调节特定基因的遗传功能。

参考资料:

[1] 运动解剖学、运动医学大辞典

[2] 新编实用医学词典

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什么是乳腺上皮细胞培养基 MEpiCM的主要用途? 1

培养基是一种人工配制的混合物质养料,用于适合生物生长的环境。它主要用于微生物的分离、培养、鉴定、保藏和酿造、发酵等方面。培养基的具体成分根据生物的营养需求而有所不同,一般包含水、碳水化合物、含氨物质和矿质盐类等。根据所用原料的不同,培养基可以分为合成培养基或综合培养基以及天然培养基。此外,培养基还可以根据是否加入赋形剂来分为固体培养基、半固体培养基和液体培养基。

乳腺上皮细胞培养基 MEpiCM是一种专门为体外培养正常人乳腺上皮细胞设计的培养基。它是一种无血清培养基,含有必需和非必需氨基酸、维生素、有机和无机化合物、激素、生长因子以及微量矿物质。乳腺上皮细胞培养基 MEpiCM采用碳酸氢盐缓冲体系,在5%二氧化碳/95%空气培养箱中平衡时,其pH值为7.4。该培养基在数量和质量上都保证了最理想的营养平衡状态,能够选择性促进体外正常人类乳腺上皮细胞的生长。乳腺上皮细胞培养基 MEpiCM的配方包括500 ml基础培养基、5 ml乳腺上皮细胞生长添加物以及5 ml青霉素/链霉素溶液。然而,乳腺上皮细胞培养基 MEpiCM仅供科研研究使用。

主要参考资料

[1] 中国卫生管理辞典

 

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培养基是一种人工配制的混合物质养料,用于适合生物生长的环境。它主要用于微生物的分离、培养、鉴定、保藏和酿造、发酵等方面。培养基的具体成分根据生物的营养需求而有所不同,一般包含水、碳水化合物、含氨物质和矿质盐类等。根据所用原料的不同,培养基可以分为合成培养基或综合培养基以及天然培养基。此外,培养基还可以根据是否加入赋形剂来分为固体培养基、半固体培养基和液体培养基。

乳腺上皮细胞培养基 MEpiCM是一种专门为体外培养正常人乳腺上皮细胞设计的培养基。它是一种无血清培养基,含有必需和非必需氨基酸、维生素、有机和无机化合物、激素、生长因子以及微量矿物质。乳腺上皮细胞培养基 MEpiCM采用碳酸氢盐缓冲体系,在5%二氧化碳/95%空气培养箱中平衡时,其pH值为7.4。该培养基在数量和质量上都保证了最理想的营养平衡状态,能够选择性促进体外正常人类乳腺上皮细胞的生长。乳腺上皮细胞培养基 MEpiCM的配方包括500 ml基础培养基、5 ml乳腺上皮细胞生长添加物以及5 ml青霉素/链霉素溶液。然而,乳腺上皮细胞培养基 MEpiCM仅供科研研究使用。

主要参考资料

[1] 中国卫生管理辞典

 

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如何分离和培养人气管上皮细胞? 1

上皮细胞是覆盖身体表面和体内空腔器官腔面的细胞,具有明显的极性。它们在保护、吸收、分泌和排泄等方面发挥着重要作用。人气管上皮细胞是气道与外界环境接触的第一道防线,对气道炎症和免疫反应起着重要作用。因此,分离和培养人气管上皮细胞对于基础和临床研究非常重要。

分离和培养方法

首先,将获取的气管组织保存在低温PBS溶液中,并用无菌PBS进行冲洗。然后,将组织切成碎片,置于含有蛋白酶XⅣ的PBS中,在4℃下消化12-24小时。消化后,使用10% FBS终止消化,并通过离心将上皮细胞分离出来。将分离的细胞重悬于BEGM培养液中,转移到培养皿中,并在37℃下孵育1小时。使用差速贴壁法除去先贴壁的成纤维细胞后,再收集上皮细胞,并调整密度后接种于胶原包被的培养皿中。在37℃,5%CO2条件下进行培养,并每天更换培养基。

ALI培养方法

在分离和培养的基础上,将上皮细胞用胰酶消化后,重悬于BEGM中,并接种于预铺人Ⅳ型胎盘胶原的Transwell支持膜上。同时,在膜下层也加入培养液BEGM,并在37℃,5%CO2培养箱中进行培养。当细胞达到80%-90%的融合时,移除支持膜上层的培养基,并只在膜下层加入ALI培养基进行培养。每天更换培养基,并在37℃,5%CO2培养箱中培养4-6周,观察记录细胞的生长和分化状况。

显微镜观察

使用光镜观察原代和ALI培养细胞的生长状况,使用电镜观察原代细胞的纤毛结构。观察结果显示,经过分离和培养后的上皮细胞生长良好,细胞数量逐渐增多。与对照组的成纤维细胞相比,分离的细胞形态符合上皮细胞的特征。

主要参考资料

[1] 儿科学辞典

[2] 人气管上皮细胞的原代分离及气液界面培养

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上皮细胞是覆盖身体表面和体内空腔器官腔面的细胞,具有明显的极性。它们在保护、吸收、分泌和排泄等方面发挥着重要作用。人气管上皮细胞是气道与外界环境接触的第一道防线,对气道炎症和免疫反应起着重要作用。因此,分离和培养人气管上皮细胞对于基础和临床研究非常重要。

分离和培养方法

首先,将获取的气管组织保存在低温PBS溶液中,并用无菌PBS进行冲洗。然后,将组织切成碎片,置于含有蛋白酶XⅣ的PBS中,在4℃下消化12-24小时。消化后,使用10% FBS终止消化,并通过离心将上皮细胞分离出来。将分离的细胞重悬于BEGM培养液中,转移到培养皿中,并在37℃下孵育1小时。使用差速贴壁法除去先贴壁的成纤维细胞后,再收集上皮细胞,并调整密度后接种于胶原包被的培养皿中。在37℃,5%CO2条件下进行培养,并每天更换培养基。

ALI培养方法

在分离和培养的基础上,将上皮细胞用胰酶消化后,重悬于BEGM中,并接种于预铺人Ⅳ型胎盘胶原的Transwell支持膜上。同时,在膜下层也加入培养液BEGM,并在37℃,5%CO2培养箱中进行培养。当细胞达到80%-90%的融合时,移除支持膜上层的培养基,并只在膜下层加入ALI培养基进行培养。每天更换培养基,并在37℃,5%CO2培养箱中培养4-6周,观察记录细胞的生长和分化状况。

显微镜观察

使用光镜观察原代和ALI培养细胞的生长状况,使用电镜观察原代细胞的纤毛结构。观察结果显示,经过分离和培养后的上皮细胞生长良好,细胞数量逐渐增多。与对照组的成纤维细胞相比,分离的细胞形态符合上皮细胞的特征。

主要参考资料

[1] 儿科学辞典

[2] 人气管上皮细胞的原代分离及气液界面培养

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什么是角质细胞培养基的主要成分和用途? 1

培养基是一种人工配制的混合物质养料,用于适合生物生长的环境。它主要用于微生物的培养、分离、鉴定、保藏以及酿造和发酵等过程。培养基的具体成分根据生物的营养需求而有所不同,一般包含水、碳水化合物、含氨物质和矿质盐类等。根据原料的不同,培养基可以分为合成培养基和天然培养基。此外,根据是否加入赋形剂,还可以分为固体培养基、半固体培养基和液体培养基。角质细胞培养基是一种专门为正常人类角质细胞体外培养设计的培养基,它最适合角质细胞的生长。无血清培养基是一种无菌的液体培养基,它不含血清,但包含必需和非必需氨基酸、维生素、有机和无机化合物、激素、生长因子以及微量矿物质。

角质细胞培养基的PH值为7.4,含有碳酸氢盐缓冲体系。该培养基在5%二氧化碳/95%空气的培养箱中平衡。它在数量和质量上都保证了最理想的营养平衡状态,能够选择性促进体外正常人类神经元的生长。需要注意的是,角质细胞培养基仅用于科研,不能用于人或动物和体外诊断应用。角质细胞培养基的配方包括500ml基础培养基、5ml角质细胞生长因子和5ml青霉素/链霉素溶液。基础液应在4℃保存,而生长因子和双抗应在-20℃保存。

主要参考资料

[1] 中国卫生管理辞典

 

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培养基是一种人工配制的混合物质养料,用于适合生物生长的环境。它主要用于微生物的培养、分离、鉴定、保藏以及酿造和发酵等过程。培养基的具体成分根据生物的营养需求而有所不同,一般包含水、碳水化合物、含氨物质和矿质盐类等。根据原料的不同,培养基可以分为合成培养基和天然培养基。此外,根据是否加入赋形剂,还可以分为固体培养基、半固体培养基和液体培养基。角质细胞培养基是一种专门为正常人类角质细胞体外培养设计的培养基,它最适合角质细胞的生长。无血清培养基是一种无菌的液体培养基,它不含血清,但包含必需和非必需氨基酸、维生素、有机和无机化合物、激素、生长因子以及微量矿物质。

角质细胞培养基的PH值为7.4,含有碳酸氢盐缓冲体系。该培养基在5%二氧化碳/95%空气的培养箱中平衡。它在数量和质量上都保证了最理想的营养平衡状态,能够选择性促进体外正常人类神经元的生长。需要注意的是,角质细胞培养基仅用于科研,不能用于人或动物和体外诊断应用。角质细胞培养基的配方包括500ml基础培养基、5ml角质细胞生长因子和5ml青霉素/链霉素溶液。基础液应在4℃保存,而生长因子和双抗应在-20℃保存。

主要参考资料

[1] 中国卫生管理辞典

 

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小鼠直肠平滑肌细胞的制备方法是什么? 1

平滑肌细胞是构成平滑肌的纤维状长细胞。它们在不同部位的长度不一致,但都具有很大的弹性和韧力。平滑肌细胞通常聚集成束,细胞轮廓不清,需要用适当的溶液将其分离,才能得到完整的细胞形态。每个平滑肌细胞都有一个细胞核,位于细胞中段最宽的部分。细胞内的胞质通常呈均质性,但在特殊染色或处理下,可以显现出纵列的肌原纤维。平滑肌细胞外面包裹着一层肌膜,周围还有少量的胶质纤维、弹力纤维和网状纤维。平滑肌细胞的来源可以是直肠组织,直肠是位于盆腔下部的一段消化管。

小鼠直肠平滑肌细胞经过原代分离培养后,细胞会贴壁伸展,形态大小不一,核呈卵圆形。随着细胞的传代,细胞生长较快,形态学特征和生长特点得到保持。小鼠直肠平滑肌细胞的制备方法是采用胰蛋白酶-胶原酶联合消化法结合差速贴壁法,细胞纯度高达90%以上,且不含有HIV-1、HBV、HCV、支原体、细菌、酵母和真菌等。

主要参考资料

[1] 新编实用医学词典

[2] 消化系统病学词典

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平滑肌细胞是构成平滑肌的纤维状长细胞。它们在不同部位的长度不一致,但都具有很大的弹性和韧力。平滑肌细胞通常聚集成束,细胞轮廓不清,需要用适当的溶液将其分离,才能得到完整的细胞形态。每个平滑肌细胞都有一个细胞核,位于细胞中段最宽的部分。细胞内的胞质通常呈均质性,但在特殊染色或处理下,可以显现出纵列的肌原纤维。平滑肌细胞外面包裹着一层肌膜,周围还有少量的胶质纤维、弹力纤维和网状纤维。平滑肌细胞的来源可以是直肠组织,直肠是位于盆腔下部的一段消化管。

小鼠直肠平滑肌细胞经过原代分离培养后,细胞会贴壁伸展,形态大小不一,核呈卵圆形。随着细胞的传代,细胞生长较快,形态学特征和生长特点得到保持。小鼠直肠平滑肌细胞的制备方法是采用胰蛋白酶-胶原酶联合消化法结合差速贴壁法,细胞纯度高达90%以上,且不含有HIV-1、HBV、HCV、支原体、细菌、酵母和真菌等。

主要参考资料

[1] 新编实用医学词典

[2] 消化系统病学词典

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细胞及分子 + 关注 4k条问题 . 709人已关注
细胞:细胞是生物体基本的结构和功能单位。分子:分子是由组成的原子按照一定的键合顺序和空间排列而结合在一起的整体,这种键合顺序和空间排列关系称为分子结构。展开
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